More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0569 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0569  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
248 aa  488  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  61.75 
 
 
252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.14 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  62.66 
 
 
236 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  64.96 
 
 
271 aa  281  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  60 
 
 
248 aa  276  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  62.72 
 
 
406 aa  259  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.8 
 
 
243 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.16 
 
 
252 aa  256  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  59.11 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  59.11 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  59.11 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  60.94 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  61.8 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.02 
 
 
242 aa  248  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  59.23 
 
 
286 aa  248  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.51 
 
 
246 aa  241  7e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  54.94 
 
 
246 aa  241  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  62.11 
 
 
231 aa  231  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  52.79 
 
 
255 aa  229  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  51.29 
 
 
257 aa  228  9e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.36 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.61 
 
 
233 aa  208  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
237 aa  206  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.37 
 
 
244 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.14 
 
 
236 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 
235 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.44 
 
 
239 aa  205  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  51.57 
 
 
239 aa  204  7e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  48.72 
 
 
238 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  46.7 
 
 
241 aa  202  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 
246 aa  201  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  48.51 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
239 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
239 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
239 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 
236 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  50.68 
 
 
234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.96 
 
 
242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50 
 
 
238 aa  195  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 
240 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 
242 aa  192  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  49.56 
 
 
235 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 
231 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 
243 aa  189  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  47.21 
 
 
239 aa  188  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  50 
 
 
229 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.98 
 
 
236 aa  186  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.06 
 
 
239 aa  186  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 
236 aa  185  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 
237 aa  185  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 
258 aa  185  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  47.3 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  48.66 
 
 
233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  47.3 
 
 
251 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 
229 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  46.4 
 
 
234 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 
252 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 
236 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  43.59 
 
 
246 aa  172  5e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  42.02 
 
 
243 aa  172  5e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  44 
 
 
270 aa  171  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  42.8 
 
 
240 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 
224 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 
239 aa  168  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 
241 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  37.22 
 
 
227 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  37.22 
 
 
227 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  44.84 
 
 
241 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  36.77 
 
 
227 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  37.22 
 
 
227 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 
230 aa  165  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 
228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 
227 aa  162  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 
231 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 
230 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 
230 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 
231 aa  158  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 
230 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  41 
 
 
246 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 
224 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  43.16 
 
 
237 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 
224 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  38.5 
 
 
223 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 
224 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 
225 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 
224 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 
228 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 
224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 
256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  37.05 
 
 
224 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 
236 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2336  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 
244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.019228 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  40.62 
 
 
230 aa  152  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 
223 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  39.82 
 
 
224 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 
228 aa  149  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>