More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2305 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2305  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  460  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1922  two component transcriptional regulator  64.04 
 
 		 228 aa  299  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2500  winged helix family two component transcriptional regulator  62.55 
 
 		 235 aa  290  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.840776  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3164  two component transcriptional regulator  60.91 
 
 		 235 aa  281  5.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4903  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.22 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.654276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0920  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.61 
 
 		 225 aa  258  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3989  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.31 
 
 		 231 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4031  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.31 
 
 		 231 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 		 228 aa  228  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 224 aa  210  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 226 aa  203  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 230 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 230 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 230 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 228 aa  191  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  46.7 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  45.78 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  44.87 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 240 aa  177  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.13 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  39.08 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  42.42 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  40.99 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  40.99 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  40.99 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  39.74 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  39.47 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.44 
 
 		 229 aa  168  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  39.29 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 227 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  37.9 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 227 aa  164  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.89 
 
 		 238 aa  164  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  39.82 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  39.37 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 406 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.39 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  41.99 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 235 aa  162  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  36.77 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 224 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  42.6 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  36.53 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  43.55 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  36.53 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  43.05 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 235 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 283 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2688  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  37.73 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0901925  normal  0.494683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4830  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.209649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.99 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4448  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  38.84 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 245 aa  159  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>