More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0130 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 224 aa  441  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 240 aa  235  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  52.7 
 
 		 224 aa  234  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 		 224 aa  234  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  52.7 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.25 
 
 		 224 aa  231  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  51.8 
 
 		 223 aa  231  8.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  52.25 
 
 		 224 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 227 aa  225  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  49.32 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 225 aa  222  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 223 aa  222  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 		 226 aa  218  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.75 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1442  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1842  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 240 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.32 
 
 		 242 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 241 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.98 
 
 		 223 aa  214  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.53 
 
 		 223 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  45.98 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  45.98 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.09 
 
 		 223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.85 
 
 		 223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.09 
 
 		 223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1599  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118902  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  45.7 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 225 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.85 
 
 		 223 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1713  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.7 
 
 		 227 aa  211  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 249 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 224 aa  211  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 230 aa  211  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  44.49 
 
 		 232 aa  211  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  45.95 
 
 		 228 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 222 aa  211  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.74 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0705  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.53 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591946 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.59 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  47.06 
 
 		 225 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.09 
 
 		 227 aa  209  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0016  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 262 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  45.05 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0376  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 232 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  44.89 
 
 		 230 aa  208  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 223 aa  209  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 263 aa  208  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  45.74 
 
 		 223 aa  208  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 228 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.29 
 
 		 225 aa  208  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 228 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.39 
 
 		 230 aa  208  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0702  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.64 
 
 		 238 aa  207  7e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.149482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 231 aa  207  7e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.95 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.3 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  46.67 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  45.05 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  43.69 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.84 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  44.59 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4663  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.64 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.95 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1233  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.19 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.4 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 223 aa  205  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  45.29 
 
 		 224 aa  204  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  43.56 
 
 		 228 aa  205  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.29 
 
 		 224 aa  204  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.64 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.64 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.64 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>