More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1922 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1922  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2500  winged helix family two component transcriptional regulator  80.43 
 
 		 235 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.840776  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3164  two component transcriptional regulator  69.09 
 
 		 235 aa  326  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2305  two component transcriptional regulator  64.04 
 
 		 228 aa  299  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79647 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0920  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.5 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4903  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.33 
 
 		 225 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.654276 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3989  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.95 
 
 		 231 aa  255  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4031  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.95 
 
 		 231 aa  254  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.54 
 
 		 224 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  53.36 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 224 aa  208  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  45.98 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  46.29 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 406 aa  178  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 229 aa  177  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  45.13 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  41.78 
 
 		 286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 246 aa  171  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.44 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 228 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 229 aa  171  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  45.09 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  41.56 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 224 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 273 aa  168  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  41.07 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.69 
 
 		 238 aa  168  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  42.49 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  43.11 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.56 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  43.44 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.44 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  40.35 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.84 
 
 		 232 aa  164  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.27 
 
 		 223 aa  164  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 232 aa  164  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  39.73 
 
 		 241 aa  162  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1744  two component transcriptional regulator  43.2 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.13 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.95 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4830  two component transcriptional regulator  42.93 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.209649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>