More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4903 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4903  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 225 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.654276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1922  two component transcriptional regulator  61.33 
 
 		 228 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3164  two component transcriptional regulator  57.33 
 
 		 235 aa  264  8e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2305  two component transcriptional regulator  58.22 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79647 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2500  winged helix family two component transcriptional regulator  56.9 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.840776  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0920  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.33 
 
 		 225 aa  238  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3989  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.68 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4031  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.68 
 
 		 231 aa  223  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 224 aa  179  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  42.79 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  37.86 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  42.36 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.86 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 223 aa  154  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  39.48 
 
 		 237 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  40.87 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 228 aa  144  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  40.17 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  37 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  37 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  37 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3240  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 229 aa  141  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 227 aa  141  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.71 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 227 aa  141  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  35.68 
 
 		 227 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4830  two component transcriptional regulator  37.16 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.209649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  37.44 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  34.93 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  48.99 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4448  two component transcriptional regulator  37.16 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130258  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4535  two component transcriptional regulator  37.16 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.636187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10921  two component system response transcriptional regulatory protein prrA  36.99 
 
 		 236 aa  138  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1744  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 231 aa  138  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.57 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5009  two component transcriptional regulator  36.53 
 
 		 233 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284196  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  40.96 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2886  response regulator receiver  36.36 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  35.68 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  40.96 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5704  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.96 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06261  two-component response regulator  38.86 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0419163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.09 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.68 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 248 aa  135  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2914  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.74 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.96 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.12 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0228  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.77 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0488  DNA-binding response regulator  41.21 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  34.8 
 
 		 286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.83 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  40.96 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.27 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.07 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.6 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  35.84 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.84 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.62 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.98 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 233 aa  131  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  32.89 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  35.96 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3413  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 240 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  35.61 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>