More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5704 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5704  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  427  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  73.27 
 
 		 221 aa  317  7e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.85 
 
 		 220 aa  311  4.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.98 
 
 		 219 aa  295  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  66.98 
 
 		 219 aa  286  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.09 
 
 		 228 aa  279  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3167  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.51 
 
 		 218 aa  278  6e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.436774  normal  0.0676898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  61.64 
 
 		 222 aa  276  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  65.3 
 
 		 220 aa  271  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2006  response regulator receiver  66.82 
 
 		 223 aa  258  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.379718  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.06 
 
 		 220 aa  258  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2389  two component transcriptional regulator  64.19 
 
 		 219 aa  256  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3998  two component transcriptional regulator  62.96 
 
 		 220 aa  251  7e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278973  normal  0.137181 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02960  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  59.19 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21520  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  59.36 
 
 		 222 aa  246  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0794896  hitchhiker  0.0000630157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4935  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.97 
 
 		 221 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4900  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.76 
 
 		 221 aa  238  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2593  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.5 
 
 		 223 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3524  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.5 
 
 		 223 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.07 
 
 		 221 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2869  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.65 
 
 		 232 aa  221  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2685  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.76 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2344  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.56 
 
 		 227 aa  208  5e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  53.64 
 
 		 227 aa  207  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.13 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 224 aa  198  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  51.14 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  48.4 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  44.09 
 
 		 226 aa  190  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 227 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 227 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.79 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7132  winged helix family two component response transcriptional regulator  81.82 
 
 		 134 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.304238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 224 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  46.36 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  43.18 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  44.1 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4710  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  45.29 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  41.01 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  45.54 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  41.82 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.64 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  40.55 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  45.91 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.89 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  45 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2234  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.85 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.162422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  45.7 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1090  DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00019826  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 		 245 aa  177  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 225 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 225 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  44.55 
 
 		 226 aa  177  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 225 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.65 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  45.7 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  40.55 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4482  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.83 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 229 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4114  response regulator receiver  48.83 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4296  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.99 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000252174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.25 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.59 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4595  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.83 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.09 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 224 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.34 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.25 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>