More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2802 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 220 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.06 
 
 		 220 aa  320  8e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  73.27 
 
 		 221 aa  320  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  66.82 
 
 		 219 aa  286  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.44 
 
 		 219 aa  279  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3167  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.43 
 
 		 218 aa  277  7e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.436774  normal  0.0676898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2389  two component transcriptional regulator  65.44 
 
 		 219 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.99 
 
 		 228 aa  269  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 222 aa  268  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3998  two component transcriptional regulator  62.56 
 
 		 220 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278973  normal  0.137181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  61.19 
 
 		 220 aa  263  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5704  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 220 aa  262  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02960  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.85 
 
 		 229 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2006  response regulator receiver  61.99 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.379718  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2344  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.27 
 
 		 227 aa  235  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21520  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.2 
 
 		 222 aa  234  5.0000000000000005e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0794896  hitchhiker  0.0000630157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4935  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.13 
 
 		 221 aa  234  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2869  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.09 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.74 
 
 		 221 aa  231  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2593  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.81 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3524  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.36 
 
 		 223 aa  228  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2685  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.55 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4900  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.45 
 
 		 221 aa  218  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  57.34 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.91 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 227 aa  207  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 227 aa  207  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4710  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.59 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.83 
 
 		 226 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  49.3 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  47.71 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  41.12 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  45.25 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  45.25 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  45.25 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  44.8 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.17 
 
 		 224 aa  188  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 224 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  44.44 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1090  DNA-binding response regulator  46.36 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00019826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 235 aa  185  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  45.79 
 
 		 220 aa  184  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 224 aa  184  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  44.91 
 
 		 223 aa  184  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  41.44 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.58 
 
 		 225 aa  184  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  45.05 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  45.05 
 
 		 224 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  41.36 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.5 
 
 		 227 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 406 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2944  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.29 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  0.70587 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 237 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 230 aa  181  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  46.08 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  42.01 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  41.55 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  42.01 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.98 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.52 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  48.11 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  44.84 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  45.41 
 
 		 253 aa  177  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0373  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 237 aa  177  8e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  43.89 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 254 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>