More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1090 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1090  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 228 aa  464  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00019826  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0898  DNA-binding response regulator  59.11 
 
 		 234 aa  274  8e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0488  DNA-binding response regulator  55.45 
 
 		 228 aa  242  3.9999999999999997e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 224 aa  198  6e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.83 
 
 		 254 aa  194  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 224 aa  194  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  43.23 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  44.25 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  45.81 
 
 		 226 aa  191  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 228 aa  191  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 226 aa  189  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 221 aa  188  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.25 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 406 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 227 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 227 aa  185  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  43.56 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 223 aa  184  7e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 283 aa  184  9e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  45.05 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  43.56 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 273 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 239 aa  181  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 239 aa  181  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 239 aa  181  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  43.05 
 
 		 233 aa  181  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.62 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.64 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.84 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  44.59 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2880  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  44.05 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 236 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  45.37 
 
 		 227 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  42.15 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  44.14 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.11 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.56 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.67 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  43.11 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 243 aa  175  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.74 
 
 		 239 aa  175  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2768  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.67 
 
 		 223 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.33 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 239 aa  175  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  41.78 
 
 		 257 aa  174  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  42.61 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  40.97 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  43.12 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  43.95 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  40.51 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  41.52 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  39.3 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.22 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>