More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0717 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.54 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  44.64 
 
 		 226 aa  201  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 240 aa  201  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  47 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  47 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 		 226 aa  194  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  43.58 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.66 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1208  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  45.58 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 236 aa  190  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  44.29 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  47.47 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  43.89 
 
 		 253 aa  189  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.87 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.87 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.87 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 222 aa  188  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.24 
 
 		 238 aa  188  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 228 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 228 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.84 
 
 		 226 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  46.58 
 
 		 223 aa  187  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  44 
 
 		 225 aa  187  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  44 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  41.85 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  45.66 
 
 		 228 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  41.85 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  45.21 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.38 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  41.28 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  41.28 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.2 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 219 aa  185  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.2 
 
 		 223 aa  184  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.21 
 
 		 225 aa  184  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 221 aa  184  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.12 
 
 		 223 aa  184  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.56 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.92 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3856  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  44.34 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.66 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.29 
 
 		 224 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.69 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.38 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3919  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2165  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.77286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.27 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3997  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.56 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3412  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.94 
 
 		 226 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2490  heavy metal response regulator  45.13 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1559  response regulator receiver  43.86 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0097  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.01 
 
 		 223 aa  181  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.28 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2768  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.66 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  42.53 
 
 		 227 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2757  response regulator receiver  42.34 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  42.53 
 
 		 227 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.2 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  42.53 
 
 		 227 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.38 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  43.95 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.29 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.5 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>