More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4900 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4900  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 221 aa  425  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  64.71 
 
 		 221 aa  272  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.09 
 
 		 220 aa  267  8e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.18 
 
 		 219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  60.27 
 
 		 219 aa  256  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3167  two component transcriptional regulator, winged helix family  65 
 
 		 218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.436774  normal  0.0676898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  57.53 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  55.66 
 
 		 222 aa  241  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2006  response regulator receiver  61.88 
 
 		 223 aa  239  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.379718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5704  two component transcriptional regulator  63.3 
 
 		 220 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.75 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21520  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.11 
 
 		 222 aa  231  9e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0794896  hitchhiker  0.0000630157 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.45 
 
 		 220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.3 
 
 		 221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2344  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.89 
 
 		 227 aa  218  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2685  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.82 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02960  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.68 
 
 		 229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3998  two component transcriptional regulator  51.14 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278973  normal  0.137181 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 227 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 227 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2389  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 219 aa  208  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4935  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.27 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3524  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2593  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 223 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 229 aa  202  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2869  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.64 
 
 		 232 aa  201  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  46.43 
 
 		 227 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  48.18 
 
 		 223 aa  195  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 235 aa  194  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.53 
 
 		 223 aa  194  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  45.95 
 
 		 224 aa  194  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1599  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  45.5 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.03 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.03 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.03 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 240 aa  190  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.88 
 
 		 236 aa  190  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  49.33 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.4 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00315  probable two component response regulator transcription regulator protein  42.79 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2725  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.87 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  45.5 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  45.16 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.8 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.51 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 230 aa  187  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.51 
 
 		 223 aa  187  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.32 
 
 		 225 aa  187  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.8 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  44.04 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  44.89 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.23 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2084  DNA-binding heavy metal response regulator  45.7 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000771382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  52.23 
 
 		 225 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2192  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.51 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.54 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  45.95 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  46.46 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  47.51 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  48.87 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.21 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 224 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 242 aa  185  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  44.25 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2743  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  40.27 
 
 		 226 aa  186  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2480  DNA-binding heavy metal response regulator  45.7 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000187636  normal  0.518539 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 		 241 aa  185  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 		 228 aa  184  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 283 aa  185  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>