More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02960 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_02960  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  100 
 
 		 229 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.05 
 
 		 220 aa  260  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  58.3 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  54.26 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2869  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.9 
 
 		 232 aa  231  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.5 
 
 		 219 aa  230  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.98 
 
 		 228 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5704  two component transcriptional regulator  57.46 
 
 		 220 aa  228  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.85 
 
 		 220 aa  227  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  52.47 
 
 		 220 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 		 222 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2006  response regulator receiver  56.05 
 
 		 223 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.379718  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3167  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.5 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.436774  normal  0.0676898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2389  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 219 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3998  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278973  normal  0.137181 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21520  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.78 
 
 		 222 aa  205  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0794896  hitchhiker  0.0000630157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2344  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.33 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4900  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3524  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 		 223 aa  194  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2593  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2685  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.98 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4935  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 228 aa  178  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0373  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  40.35 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 240 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  42.86 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  39.91 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 222 aa  175  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.45 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 235 aa  171  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.99 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.99 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  40 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.77 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.04 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.99 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  41.05 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.77 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.99 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  40.61 
 
 		 227 aa  167  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  40.61 
 
 		 227 aa  167  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0197  transcriptional activator protein, response regulator  37.72 
 
 		 227 aa  167  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0086442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 224 aa  167  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  40.61 
 
 		 227 aa  167  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  40.79 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  39.43 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  40.61 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03590  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.54 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0594239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  41.23 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  42.11 
 
 		 226 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  37.72 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0990  transcriptional regulator  40.26 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3856  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 		 227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.54 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.27 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.27 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.27 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  39.38 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  41.23 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>