More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1613 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  100 
 
 		 225 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  69.64 
 
 		 224 aa  309  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  66.82 
 
 		 227 aa  296  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.96 
 
 		 225 aa  294  6e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.5 
 
 		 225 aa  286  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  64.09 
 
 		 222 aa  284  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  62.27 
 
 		 225 aa  280  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  60 
 
 		 226 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1324  response regulator receiver  61.36 
 
 		 223 aa  272  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.73 
 
 		 223 aa  268  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.38 
 
 		 236 aa  267  8.999999999999999e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4842  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.54 
 
 		 225 aa  264  8.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.649395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1594  response regulator receiver  62.9 
 
 		 219 aa  252  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.349405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  58.18 
 
 		 283 aa  251  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.8 
 
 		 225 aa  247  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1554  two component transcriptional regulator  61.09 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.083917  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  56.82 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.02 
 
 		 226 aa  243  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  59.01 
 
 		 217 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  53.36 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  60 
 
 		 218 aa  238  5e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  50 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 223 aa  224  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  51.82 
 
 		 225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1622  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.34 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153936  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  51.82 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.27 
 
 		 225 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  51.82 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.73 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.73 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.73 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  48.18 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.45 
 
 		 225 aa  214  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 223 aa  214  8e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  47.27 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  48.64 
 
 		 224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  50.68 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.68 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  50.23 
 
 		 224 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.23 
 
 		 224 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.23 
 
 		 224 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.23 
 
 		 224 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4296  DNA-binding transcriptional activator CusR  47.96 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000252174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.23 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3426  DNA-binding transcriptional activator CusR  47.96 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 225 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  49.09 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  51.36 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.54 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  44.64 
 
 		 230 aa  207  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 231 aa  207  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.09 
 
 		 224 aa  207  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0258  DNA-binding transcriptional activator CusR  47.51 
 
 		 226 aa  207  9e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  48.87 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  47.25 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00315  probable two component response regulator transcription regulator protein  45 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  50.23 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  48.66 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.77 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4663  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.78 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  49.55 
 
 		 225 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.64 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.08 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  49.32 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  49.32 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.41 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  49.32 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  49.32 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00532  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CusS  49.32 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  50.23 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  49.32 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  49.32 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.32 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 227 aa  204  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0836  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.45 
 
 		 224 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  47.3 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.32 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 223 aa  203  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.06 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  50.23 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.42 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.64 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 223 aa  201  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  49.77 
 
 		 229 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 225 aa  201  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 222 aa  201  9e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1208  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.15 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>