More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2231 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  63.68 
 
 		 226 aa  279  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.64 
 
 		 227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  59.11 
 
 		 228 aa  258  7e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1044  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.39 
 
 		 234 aa  249  4e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  58.41 
 
 		 227 aa  248  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  58.41 
 
 		 227 aa  248  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  58.41 
 
 		 227 aa  248  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  58.85 
 
 		 227 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.16 
 
 		 224 aa  244  8e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00280  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  57.64 
 
 		 234 aa  243  9.999999999999999e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  55.16 
 
 		 224 aa  241  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.57 
 
 		 223 aa  238  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  55.36 
 
 		 224 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  54.26 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  53.54 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  52.89 
 
 		 229 aa  228  5e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  53.54 
 
 		 228 aa  228  8e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  51.56 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 225 aa  225  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 219 aa  224  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  53.71 
 
 		 229 aa  224  7e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  49.78 
 
 		 219 aa  224  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 224 aa  223  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  52.81 
 
 		 229 aa  223  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000041064  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.34 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  50.43 
 
 		 246 aa  218  7e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0488  DNA-binding response regulator  52.25 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 224 aa  215  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  52.04 
 
 		 225 aa  214  5.9999999999999996e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1090  DNA-binding response regulator  49.12 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00019826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0898  DNA-binding response regulator  48.26 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0989  DNA-binding response regulator ArlR  50.45 
 
 		 219 aa  208  7e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110636  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  51.57 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  51.57 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  51.57 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1171  transcriptional regulatory protein YedW  47.95 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 240 aa  205  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1191  transcriptional regulatory protein YedW  47.49 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1160  transcriptional regulatory protein YedW  47.49 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.728212 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  51.82 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1055  transcriptional regulatory protein YedW  47.49 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  46.61 
 
 		 223 aa  202  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  50.45 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.2 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 225 aa  201  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  47.27 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.23 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.23 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.49 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.58 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  46.75 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  45.95 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2388  heavy metal response regulator  49.33 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 225 aa  198  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 406 aa  198  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  45.58 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.96 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.06 
 
 		 236 aa  198  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.62 
 
 		 238 aa  198  7e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.77 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.32 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 224 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  45.95 
 
 		 236 aa  197  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 228 aa  197  9e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 224 aa  197  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  48.2 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.82 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.58 
 
 		 226 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  45.5 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.87 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 		 222 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 223 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>