More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1174 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  80.8 
 
 		 224 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  78.03 
 
 		 224 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  78.03 
 
 		 224 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  78.03 
 
 		 224 aa  359  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  75.89 
 
 		 224 aa  358  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  75.89 
 
 		 224 aa  358  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0029  DNA-binding response regulator CzrR  71.75 
 
 		 224 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  71.75 
 
 		 224 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  71.75 
 
 		 224 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.955175  hitchhiker  0.00039578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0046  two component heavy metal response transcriptional regulator  71.75 
 
 		 224 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  73.21 
 
 		 224 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  73.21 
 
 		 224 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  73.21 
 
 		 224 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  73.21 
 
 		 224 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2714  putative two-component response regulator  71.88 
 
 		 224 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31960  putative two-component response regulator  71.88 
 
 		 224 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.029957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4558  two component heavy metal response transcriptional regulator  66.82 
 
 		 226 aa  309  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  65.02 
 
 		 226 aa  293  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  63.68 
 
 		 226 aa  288  6e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  62.78 
 
 		 228 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  63.96 
 
 		 228 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  59.91 
 
 		 228 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  62.78 
 
 		 228 aa  281  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  62.78 
 
 		 228 aa  281  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.47 
 
 		 232 aa  281  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.88 
 
 		 230 aa  280  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.78 
 
 		 225 aa  279  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  61.54 
 
 		 225 aa  279  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  63.23 
 
 		 224 aa  278  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  62.78 
 
 		 228 aa  278  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.99 
 
 		 227 aa  277  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  61.54 
 
 		 225 aa  277  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  61.88 
 
 		 228 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  58.3 
 
 		 229 aa  276  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  62.78 
 
 		 225 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  62.05 
 
 		 223 aa  275  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  61.71 
 
 		 224 aa  275  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  62.1 
 
 		 219 aa  275  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.16 
 
 		 224 aa  275  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  62.44 
 
 		 229 aa  274  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  62.78 
 
 		 225 aa  274  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  62.33 
 
 		 227 aa  271  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  56.5 
 
 		 229 aa  270  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  59.19 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1208  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  63.11 
 
 		 226 aa  270  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.38 
 
 		 223 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.88 
 
 		 225 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.19 
 
 		 231 aa  268  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.43 
 
 		 225 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2165  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  60.54 
 
 		 232 aa  267  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.77286 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1180  transcriptional activator IrlR  61.16 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0831411  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1028  DNA-binding response regulator IrlR  61.16 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0282692  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0836  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.85 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0010  transcriptional activator IrlR  61.16 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121051  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0030  DNA-binding response regulator IrlR  61.16 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1524  transcriptional activator protein IrlR  61.16 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1439  transcriptional activator IrlR  61.16 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.82 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0402  transcriptional activator IrlR  61.16 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0800763  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.85 
 
 		 224 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.36 
 
 		 225 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1376  DNA-binding response regulator IrlR  61.16 
 
 		 229 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.498923  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3842  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.54 
 
 		 227 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4683  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.54 
 
 		 228 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222547  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3680  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.54 
 
 		 228 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  60.27 
 
 		 228 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.88 
 
 		 225 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.82 
 
 		 225 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.88 
 
 		 225 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.88 
 
 		 225 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2430  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.09 
 
 		 227 aa  264  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2215  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  58.85 
 
 		 228 aa  264  8.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.46 
 
 		 226 aa  263  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  56 
 
 		 230 aa  263  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6173  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.09 
 
 		 228 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1510  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  60.54 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4933  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  57.73 
 
 		 223 aa  262  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.344735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2490  heavy metal response regulator  62.33 
 
 		 228 aa  262  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.95 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.74 
 
 		 223 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  62.78 
 
 		 227 aa  261  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2960  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.27 
 
 		 227 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.74 
 
 		 223 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  57.73 
 
 		 223 aa  261  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  58.93 
 
 		 226 aa  261  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  58.48 
 
 		 223 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3374  heavy metal response regulator  59.19 
 
 		 229 aa  261  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6111  regulator protein CopR  62.78 
 
 		 228 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110686  normal  0.158568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4663  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.95 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1742  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  63.23 
 
 		 228 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.595604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.93 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.85 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  63.06 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.93 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.74 
 
 		 223 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.93 
 
 		 226 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  57.66 
 
 		 226 aa  259  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.11 
 
 		 225 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.11 
 
 		 225 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>