More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0836 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0836  two component heavy metal response transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  98.21 
 
 		 224 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4663  two component heavy metal response transcriptional regulator  90.58 
 
 		 225 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1307  DNA-binding heavy metal response regulator  86.55 
 
 		 225 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1127  heavy metal response regulator  85.2 
 
 		 225 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294376  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  81.7 
 
 		 229 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  81.7 
 
 		 229 aa  363  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  74.44 
 
 		 231 aa  336  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2069  two component heavy metal response transcriptional regulator  72.07 
 
 		 228 aa  321  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5873  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  72.07 
 
 		 228 aa  321  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6519  two component heavy metal response transcriptional regulator  71.17 
 
 		 228 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2084  DNA-binding heavy metal response regulator  69.64 
 
 		 230 aa  310  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000771382  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2192  two component heavy metal response transcriptional regulator  69.64 
 
 		 230 aa  310  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2480  DNA-binding heavy metal response regulator  69.2 
 
 		 230 aa  308  5.9999999999999995e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000187636  normal  0.518539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1729  two component heavy metal response transcriptional regulator  71.17 
 
 		 231 aa  300  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4315  two component heavy metal response transcriptional regulator  71.62 
 
 		 232 aa  300  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.767231  normal  0.644171 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3227  two component heavy metal response transcriptional regulator  71.17 
 
 		 231 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303749  normal  0.0627816 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4186  two component heavy metal response transcriptional regulator  71.17 
 
 		 231 aa  299  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.24384  normal  0.790942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4076  two component heavy metal response transcriptional regulator  71.17 
 
 		 231 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105833  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3708  two component heavy metal response transcriptional regulator  71.17 
 
 		 231 aa  299  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4290  two component heavy metal response transcriptional regulator  71.17 
 
 		 231 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  66.23 
 
 		 232 aa  295  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  63.23 
 
 		 225 aa  295  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  63.27 
 
 		 228 aa  295  5e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  62.44 
 
 		 226 aa  290  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2215  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  63.88 
 
 		 228 aa  286  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  61.54 
 
 		 226 aa  285  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  60.54 
 
 		 224 aa  278  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.61 
 
 		 225 aa  277  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.16 
 
 		 225 aa  277  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4558  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.11 
 
 		 226 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  56.7 
 
 		 225 aa  274  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  60.54 
 
 		 223 aa  274  8e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.36 
 
 		 230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  59.73 
 
 		 229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.91 
 
 		 225 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  60.91 
 
 		 225 aa  272  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.74 
 
 		 223 aa  272  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.19 
 
 		 223 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  56.7 
 
 		 225 aa  271  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.3 
 
 		 223 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.26 
 
 		 225 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.26 
 
 		 225 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.26 
 
 		 225 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  60.73 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.74 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.74 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.21 
 
 		 224 aa  269  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1208  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  61.54 
 
 		 226 aa  268  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.04 
 
 		 224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.67 
 
 		 226 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.46 
 
 		 227 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  60.18 
 
 		 228 aa  268  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2388  heavy metal response regulator  60.18 
 
 		 228 aa  268  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.37 
 
 		 223 aa  268  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.73 
 
 		 219 aa  268  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  59.64 
 
 		 228 aa  267  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4933  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  60.27 
 
 		 223 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.344735 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  59.01 
 
 		 228 aa  266  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0102  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.64 
 
 		 223 aa  266  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.753235  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1713  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.53 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.85 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  59.19 
 
 		 228 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.54 
 
 		 225 aa  265  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  60 
 
 		 226 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.4 
 
 		 223 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.91 
 
 		 226 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.64 
 
 		 224 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.11 
 
 		 226 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2768  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.4 
 
 		 223 aa  261  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.4 
 
 		 223 aa  261  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.67 
 
 		 225 aa  261  6e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.18 
 
 		 225 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  59.19 
 
 		 224 aa  260  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.19 
 
 		 224 aa  260  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  57.21 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  57.21 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5607  two-component response regulator  58.74 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  54.39 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64570  two-component response regulator  58.74 
 
 		 229 aa  258  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  57.21 
 
 		 228 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.78 
 
 		 227 aa  256  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3722  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  57.85 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  58.3 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  56.7 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  57.14 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0708  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.25 
 
 		 226 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328024  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1510  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  57.4 
 
 		 227 aa  255  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2960  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.76 
 
 		 227 aa  255  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  58.3 
 
 		 223 aa  254  7e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2430  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.25 
 
 		 227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0376  DNA-binding response regulator IrlR  56.5 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.083776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  55.8 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3842  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.25 
 
 		 227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4683  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.25 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222547  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3680  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.25 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2716  DNA-binding heavy metal response regulator  56.5 
 
 		 230 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558922  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3374  heavy metal response regulator  55.61 
 
 		 229 aa  252  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0197  transcriptional activator protein, response regulator  52.89 
 
 		 227 aa  252  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0086442  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2869  transcriptional activator protein IrlR  56.5 
 
 		 230 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.354021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>