More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0537 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 224 aa  443  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  49.55 
 
 		 223 aa  239  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 240 aa  237  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  48.66 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  48.65 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 227 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 226 aa  214  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 226 aa  214  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1142  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.58 
 
 		 231 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.58 
 
 		 231 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.14 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 223 aa  207  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5305  winged helix family two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 244 aa  207  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  48.43 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 232 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 224 aa  204  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  45 
 
 		 225 aa  203  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 224 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0317  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 224 aa  202  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  44.2 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  44.2 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 224 aa  201  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 225 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 225 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  44.59 
 
 		 225 aa  201  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.91 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  45 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.91 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  44.3 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  46.22 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1490  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.61 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.55 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  45.78 
 
 		 226 aa  198  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.55 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1208  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 226 aa  198  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 223 aa  198  7e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 236 aa  197  7e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 226 aa  197  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 227 aa  197  7.999999999999999e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 224 aa  197  7.999999999999999e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.91 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  42.6 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  46.15 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  43.67 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  45.09 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0376  DNA-binding response regulator IrlR  44.64 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.083776  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.75 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 233 aa  194  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>