More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10613 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  100 
 
 		 253 aa  500  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.5 
 
 		 226 aa  274  8e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  58.82 
 
 		 283 aa  258  8e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  59.73 
 
 		 235 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 222 aa  228  9e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  52.49 
 
 		 226 aa  227  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  51.82 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 236 aa  225  6e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  50 
 
 		 225 aa  225  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  54.02 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  48.2 
 
 		 223 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  52 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  48.66 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  50.9 
 
 		 222 aa  215  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 224 aa  211  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  46.61 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4842  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 225 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.649395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 225 aa  208  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  45.7 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  44.8 
 
 		 224 aa  205  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  44.8 
 
 		 224 aa  205  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 228 aa  202  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.2 
 
 		 223 aa  202  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  45.7 
 
 		 226 aa  201  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1324  response regulator receiver  47.27 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4558  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.98 
 
 		 226 aa  198  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 		 223 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 		 223 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.78 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.14 
 
 		 231 aa  194  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1594  response regulator receiver  53.18 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.349405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1559  response regulator receiver  48.02 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.64 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0046  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0029  DNA-binding response regulator CzrR  46.36 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.955175  hitchhiker  0.00039578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1554  two component transcriptional regulator  51.82 
 
 		 218 aa  191  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.083917  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.61 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1713  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.67 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.96 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.21 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  44.2 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.35 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1842  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.35 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.82 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  47.16 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.64 
 
 		 225 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 224 aa  189  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.64 
 
 		 225 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.64 
 
 		 225 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2768  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  48.44 
 
 		 232 aa  188  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.09 
 
 		 217 aa  188  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.74 
 
 		 225 aa  188  8e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  45.7 
 
 		 224 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 224 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  45.91 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3531  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.79 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  46.9 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3465  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.33 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  47.27 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.11 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.11 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>