More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1554 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1554  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  421  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.083917  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1594  response regulator receiver  95.41 
 
 		 219 aa  384  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.349405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  71.82 
 
 		 224 aa  300  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4842  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.68 
 
 		 225 aa  285  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.649395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  68.06 
 
 		 217 aa  275  5e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  61.09 
 
 		 225 aa  267  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.2 
 
 		 218 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.64 
 
 		 225 aa  258  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  58.18 
 
 		 225 aa  254  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  58.64 
 
 		 227 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  59.09 
 
 		 226 aa  248  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.09 
 
 		 236 aa  248  5e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.27 
 
 		 225 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1324  response regulator receiver  56.36 
 
 		 223 aa  234  9e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  57.73 
 
 		 222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  55.86 
 
 		 283 aa  226  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  55.45 
 
 		 235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.36 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.45 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  48.64 
 
 		 223 aa  215  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  51.82 
 
 		 253 aa  210  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  51.13 
 
 		 240 aa  205  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 224 aa  204  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1622  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.42 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 224 aa  201  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.07 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 223 aa  198  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.64 
 
 		 225 aa  197  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0753  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.05 
 
 		 241 aa  195  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.407347  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.46 
 
 		 221 aa  193  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  48.37 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.91 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1841  two component transcriptional regulator  50.47 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0207334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 227 aa  187  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 236 aa  187  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  46.85 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.82 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  47.96 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.91 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0003  response regulator receiver  47.44 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  47.47 
 
 		 228 aa  183  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 231 aa  183  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  46.76 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 237 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  44.04 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 230 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  45.37 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.12 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  45.5 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  43.72 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  44.91 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  47.51 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 225 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 225 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  45 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 225 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.45 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  45.7 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.09 
 
 		 231 aa  181  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4933  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.58 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.344735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  44.09 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.12 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.12 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.12 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  47.51 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  47.98 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  49.3 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03101  two-component response regulator transcription regulator protein  49.1 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.8 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1913  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.16 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.18 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0836  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  45.25 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>