More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2104 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  64.86 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  63.11 
 
 		 224 aa  291  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  62.5 
 
 		 225 aa  286  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.67 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  60 
 
 		 236 aa  281  5.000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  60.89 
 
 		 225 aa  277  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.27 
 
 		 223 aa  271  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  58.3 
 
 		 227 aa  269  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  59.09 
 
 		 226 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1324  response regulator receiver  55.61 
 
 		 223 aa  251  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4842  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.74 
 
 		 225 aa  251  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.649395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.61 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.66 
 
 		 217 aa  241  7e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.31 
 
 		 218 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  51.82 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1594  response regulator receiver  57.73 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.349405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 283 aa  226  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 226 aa  224  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1554  two component transcriptional regulator  57.27 
 
 		 218 aa  224  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.083917  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  48.18 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.09 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  46.43 
 
 		 224 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.22 
 
 		 224 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 		 224 aa  214  9e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  45.98 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  45.98 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  45.54 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  48.44 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  45.91 
 
 		 224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0836  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.33 
 
 		 224 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1622  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.79 
 
 		 223 aa  211  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153936  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.67 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4663  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.11 
 
 		 225 aa  208  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.1 
 
 		 226 aa  207  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.64 
 
 		 225 aa  207  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  50.67 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1307  DNA-binding heavy metal response regulator  49.09 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.67 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.64 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1127  heavy metal response regulator  48.64 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294376  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  49.77 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  49.09 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.11 
 
 		 225 aa  204  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  49.32 
 
 		 229 aa  204  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 223 aa  204  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.45 
 
 		 223 aa  203  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.45 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.45 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.11 
 
 		 225 aa  203  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  48.2 
 
 		 223 aa  202  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  48.64 
 
 		 224 aa  202  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.67 
 
 		 225 aa  202  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  47.71 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  45 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  45 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  47.51 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  45 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1658  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 225 aa  202  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.25 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.88 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 		 266 aa  201  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  47.11 
 
 		 225 aa  201  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  45.87 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  47.06 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  47.3 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.96 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0317  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0197  transcriptional activator protein, response regulator  44.64 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0086442  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5873  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2069  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.33 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  47.06 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>