More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4842 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4842  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.649395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  68.16 
 
 		 224 aa  310  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  60.54 
 
 		 225 aa  285  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1554  two component transcriptional regulator  69.68 
 
 		 218 aa  284  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.083917  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1594  response regulator receiver  68.33 
 
 		 219 aa  280  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.349405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.74 
 
 		 225 aa  271  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  58.93 
 
 		 227 aa  267  8e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.64 
 
 		 225 aa  266  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.05 
 
 		 236 aa  264  7e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  61.82 
 
 		 217 aa  264  7e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.8 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1324  response regulator receiver  57.4 
 
 		 223 aa  256  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  57.21 
 
 		 222 aa  252  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  54.09 
 
 		 226 aa  245  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.5 
 
 		 218 aa  241  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.45 
 
 		 223 aa  241  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 		 232 aa  236  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  52.91 
 
 		 253 aa  228  5e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1622  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.25 
 
 		 223 aa  225  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  49.55 
 
 		 223 aa  224  8e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 226 aa  224  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  48.18 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.67 
 
 		 225 aa  214  8e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  46.82 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  46.36 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  46.36 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 224 aa  209  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 223 aa  204  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.91 
 
 		 225 aa  202  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 222 aa  201  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  46.85 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.04 
 
 		 222 aa  197  9e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0753  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 241 aa  194  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.407347  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1442  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1205  two component transcriptional regulator  43.58 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  48.44 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.5 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 228 aa  191  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.64 
 
 		 224 aa  191  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.27 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0528  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.82 
 
 		 223 aa  191  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1842  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 240 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.82 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 241 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  45.74 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.74 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1658  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 227 aa  187  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4558  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.61 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  43.89 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.25 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.74 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  44.64 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>