More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1294 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 218 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  73.49 
 
 		 217 aa  294  6e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  66.36 
 
 		 224 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.96 
 
 		 225 aa  245  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  60 
 
 		 225 aa  238  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1554  two component transcriptional regulator  66.2 
 
 		 218 aa  238  6.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.083917  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  56.76 
 
 		 227 aa  237  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1594  response regulator receiver  67.13 
 
 		 219 aa  235  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.349405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.45 
 
 		 236 aa  234  5.0000000000000005e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.31 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.95 
 
 		 225 aa  231  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.45 
 
 		 223 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1324  response regulator receiver  55.91 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  54.55 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4842  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.5 
 
 		 225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.649395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  54.09 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  49.08 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  46.64 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.91 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1622  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.45 
 
 		 223 aa  198  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  47.71 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  51.36 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0753  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.95 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.407347  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  51.8 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 		 232 aa  192  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.87 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0003  response regulator receiver  49.3 
 
 		 235 aa  181  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 		 220 aa  177  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 222 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  42.2 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.3 
 
 		 220 aa  174  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.38 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  42.47 
 
 		 229 aa  171  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  47.71 
 
 		 223 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  42.47 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  46.15 
 
 		 257 aa  170  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  43.52 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  43.52 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  43.06 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  47.69 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  47.69 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  47.69 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  47.69 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  47.69 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.66 
 
 		 227 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.5 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 221 aa  168  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  44.2 
 
 		 228 aa  167  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  41.74 
 
 		 224 aa  167  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  43.93 
 
 		 223 aa  167  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1841  two component transcriptional regulator  45.62 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0207334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.29 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.58 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1884  two component transcriptional regulator  47.2 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  43.98 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  41.1 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.93 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  38.46 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  42.49 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.66 
 
 		 222 aa  165  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  43.84 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.29 
 
 		 227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  46.3 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  46.3 
 
 		 220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  47.66 
 
 		 241 aa  164  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.5 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  45.91 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>