More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4535 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  453  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  66.82 
 
 		 225 aa  296  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.47 
 
 		 225 aa  289  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  60.99 
 
 		 224 aa  274  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  58.93 
 
 		 225 aa  272  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.3 
 
 		 225 aa  269  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  59.55 
 
 		 222 aa  267  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1324  response regulator receiver  57.85 
 
 		 223 aa  267  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  58.64 
 
 		 226 aa  261  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.05 
 
 		 236 aa  255  3e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.27 
 
 		 223 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4842  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.93 
 
 		 225 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.649395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.76 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.53 
 
 		 217 aa  234  9e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  52.27 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.91 
 
 		 225 aa  231  6e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1594  response regulator receiver  60 
 
 		 219 aa  231  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.349405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  52.73 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  52.4 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1554  two component transcriptional regulator  58.64 
 
 		 218 aa  228  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.083917  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 232 aa  222  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 240 aa  215  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  47.53 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1622  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.14 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153936  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 225 aa  204  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  48.43 
 
 		 253 aa  203  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 223 aa  202  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.09 
 
 		 225 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.45 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.45 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.45 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.09 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.09 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.64 
 
 		 224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  45.98 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  48.21 
 
 		 225 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  49.77 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 266 aa  194  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1307  DNA-binding heavy metal response regulator  46.7 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1127  heavy metal response regulator  46.7 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294376  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0836  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4663  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  49.32 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  46.82 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.09 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  46.46 
 
 		 229 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 226 aa  190  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0317  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.09 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  47.09 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.09 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6519  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.64 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5873  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2069  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.49 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  47.16 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  45.5 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  45.7 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.53 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  45 
 
 		 224 aa  188  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1658  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 236 aa  188  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2388  heavy metal response regulator  47.16 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.16 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  45.25 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.25 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.25 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.25 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  45.25 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.09 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2430  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.19 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3842  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.19 
 
 		 227 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4389  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0708  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328024  normal  0.9016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>