More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37500 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  66.82 
 
 		 222 aa  298  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  62.16 
 
 		 226 aa  285  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  61.54 
 
 		 224 aa  282  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.45 
 
 		 236 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  62.27 
 
 		 225 aa  280  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.22 
 
 		 225 aa  278  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.89 
 
 		 225 aa  277  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  58.64 
 
 		 232 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  58.93 
 
 		 227 aa  272  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1324  response regulator receiver  62.73 
 
 		 223 aa  269  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.27 
 
 		 223 aa  262  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.73 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  53.18 
 
 		 235 aa  244  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4842  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.8 
 
 		 225 aa  241  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.649395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1594  response regulator receiver  59.55 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.349405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  53.64 
 
 		 283 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.05 
 
 		 225 aa  237  9e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.73 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1554  two component transcriptional regulator  58.18 
 
 		 218 aa  234  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.083917  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.95 
 
 		 218 aa  231  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  51.82 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.09 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 		 240 aa  215  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  44.84 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  45.91 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  45 
 
 		 231 aa  207  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  46.61 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.61 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.3 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1622  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.42 
 
 		 223 aa  205  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153936  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 222 aa  204  9e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 225 aa  202  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2480  DNA-binding heavy metal response regulator  47.75 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000187636  normal  0.518539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.18 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  46.22 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  45.74 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  46.85 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 224 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.09 
 
 		 223 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  46.85 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2084  DNA-binding heavy metal response regulator  47.3 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000771382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.09 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.55 
 
 		 223 aa  201  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2192  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.3 
 
 		 230 aa  201  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.09 
 
 		 223 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  201  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  46.4 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.64 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.64 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.09 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  46.15 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  46.85 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  45.29 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  45 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  47.53 
 
 		 229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  46.85 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  46.82 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  44.84 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0836  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.55 
 
 		 224 aa  197  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 226 aa  198  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.4 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.91 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3722  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.87 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4933  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.344735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 225 aa  195  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.73 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 227 aa  194  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 232 aa  193  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  45.25 
 
 		 229 aa  193  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  46.64 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  45.05 
 
 		 228 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0317  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 224 aa  192  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0702  two component heavy metal response transcriptional regulator  40 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.149482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  45.25 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>