More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1594 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1594  response regulator receiver  100 
 
 		 219 aa  423  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.349405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1554  two component transcriptional regulator  95.41 
 
 		 218 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.083917  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  70.91 
 
 		 224 aa  293  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  69.91 
 
 		 217 aa  281  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4842  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.33 
 
 		 225 aa  281  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.649395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  62.9 
 
 		 225 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  59.55 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.13 
 
 		 218 aa  256  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.64 
 
 		 225 aa  254  7e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.45 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  60 
 
 		 226 aa  252  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 227 aa  251  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.73 
 
 		 225 aa  248  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  59.09 
 
 		 222 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1324  response regulator receiver  56.82 
 
 		 223 aa  232  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  57.27 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.85 
 
 		 223 aa  228  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  56.76 
 
 		 283 aa  224  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.82 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  49.09 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  53.18 
 
 		 253 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  51.38 
 
 		 225 aa  210  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  48.18 
 
 		 224 aa  208  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  51.13 
 
 		 240 aa  205  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1622  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.79 
 
 		 223 aa  205  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 224 aa  204  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.54 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 225 aa  202  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 223 aa  201  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.09 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  49.77 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0753  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.96 
 
 		 241 aa  199  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.407347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.09 
 
 		 225 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 224 aa  197  7e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 223 aa  197  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.39 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  48.2 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 222 aa  194  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.91 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1841  two component transcriptional regulator  51.87 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0207334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.98 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  48.87 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  46.05 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0003  response regulator receiver  48.84 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.64 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 223 aa  188  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0836  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.64 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 		 221 aa  188  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  49.32 
 
 		 229 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.82 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 225 aa  187  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  49.32 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  47.3 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.91 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  51.16 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  49.78 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  51.36 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  46.61 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  45.41 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.09 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 230 aa  184  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_003296  RS03101  two-component response regulator transcription regulator protein  50.45 
 
 		 226 aa  184  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 230 aa  183  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  44.91 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.58 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4933  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.95 
 
 		 223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.344735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 248 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.25 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 273 aa  183  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.58 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.55 
 
 		 223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  45 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.58 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  46.15 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  44.55 
 
 		 223 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  45 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  47.06 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.06 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.09 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>