More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2062 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  435  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1559  response regulator receiver  87.39 
 
 		 228 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  51.77 
 
 		 283 aa  205  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  52.04 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5331  transcriptional regulator two components regulatory system  46.7 
 
 		 225 aa  198  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.66 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 228 aa  195  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  48.2 
 
 		 222 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 225 aa  194  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  47.77 
 
 		 225 aa  194  9e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  47.51 
 
 		 253 aa  192  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0029  DNA-binding response regulator CzrR  46.36 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0046  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.955175  hitchhiker  0.00039578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.67 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  47.98 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 232 aa  188  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  47.77 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.06 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 238 aa  185  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4558  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 226 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0376  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.09 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 231 aa  184  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.56 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  45.7 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3426  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.6 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.98 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4296  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.15 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000252174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 227 aa  181  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  45.91 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.98 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  45.91 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.37 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.08 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  43.05 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0258  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.15 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00532  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CusS  42.6 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.6 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  42.6 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  45.21 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.6 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.6 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.6 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.6 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1442  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  46.82 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.82 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.84 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.84 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2165  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.77286 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.53 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  46.36 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.53 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.53 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.16 
 
 		 224 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 226 aa  177  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  46.9 
 
 		 232 aa  177  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.78 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 225 aa  177  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.82 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6519  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.29 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0435386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>