More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0920 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0920  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 225 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4031  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.92 
 
 		 231 aa  289  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3989  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.92 
 
 		 231 aa  289  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1922  two component transcriptional regulator  56.5 
 
 		 228 aa  270  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3164  two component transcriptional regulator  55.45 
 
 		 235 aa  264  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2500  winged helix family two component transcriptional regulator  54.89 
 
 		 235 aa  261  6.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.840776  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2305  two component transcriptional regulator  55.61 
 
 		 228 aa  258  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79647 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4903  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.33 
 
 		 225 aa  238  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.654276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 224 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 224 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  43.3 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.94 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 226 aa  155  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.01 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  42.41 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  39.48 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 227 aa  148  9e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  43.18 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  39.11 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  38.94 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  36.94 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  36.94 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  36.94 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 		 224 aa  141  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 235 aa  141  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  42.05 
 
 		 224 aa  141  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 		 223 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4830  two component transcriptional regulator  40.2 
 
 		 233 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.209649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4448  two component transcriptional regulator  40.2 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130258  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4535  two component transcriptional regulator  40.2 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.636187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10921  two component system response transcriptional regulatory protein prrA  41.44 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3167  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.05 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.436774  normal  0.0676898 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1744  two component transcriptional regulator  41.8 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5009  two component transcriptional regulator  41.8 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284196  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  40.22 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 273 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 223 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.01 
 
 		 226 aa  134  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0488  DNA-binding response regulator  33.19 
 
 		 228 aa  134  8e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.22 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.36 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  40.49 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  38.46 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 243 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  35.22 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  34.51 
 
 		 236 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 243 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 243 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06261  two-component response regulator  36.19 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0419163 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  35.37 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.24 
 
 		 244 aa  131  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  36.2 
 
 		 229 aa  131  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  35.56 
 
 		 231 aa  131  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  32.75 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.91 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>