More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3164 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3164  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  480  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1922  two component transcriptional regulator  69.09 
 
 		 228 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2500  winged helix family two component transcriptional regulator  64.5 
 
 		 235 aa  315  5e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.840776  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2305  two component transcriptional regulator  60.91 
 
 		 228 aa  281  5.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79647 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4903  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.33 
 
 		 225 aa  264  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.654276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0920  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.45 
 
 		 225 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3989  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.04 
 
 		 231 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4031  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.04 
 
 		 231 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.36 
 
 		 224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 224 aa  206  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 226 aa  201  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  40.18 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  37.08 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 224 aa  168  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  40.09 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  40.27 
 
 		 286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  40.27 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  38.77 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 406 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  37.39 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.34 
 
 		 235 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  40.53 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  41.82 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0097  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.36 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 227 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 225 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10921  two component system response transcriptional regulatory protein prrA  40 
 
 		 236 aa  157  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1744  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 231 aa  157  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4392  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0025821  decreased coverage  0.00000564878 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4900  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  38.72 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5009  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284196  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.27 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.84 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  35.43 
 
 		 229 aa  156  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4783  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000784885  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2725  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.53 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.22 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4830  two component transcriptional regulator  39.51 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.209649 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.05 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>