More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2487 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1142  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.78 
 
 		 227 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5305  winged helix family two component transcriptional regulator  61.28 
 
 		 244 aa  291  6e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217359  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.91 
 
 		 238 aa  284  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1544  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.91 
 
 		 237 aa  278  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2647  response regulator receiver domain-containing protein  52.86 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.58 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5187  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000511147 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 223 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3923  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 226 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  48.28 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2027  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 240 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.05 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 231 aa  188  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 652 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 224 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2453  winged helix family two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 236 aa  185  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 224 aa  184  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1236  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 222 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0691  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 227 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 224 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 635 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 224 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 222 aa  178  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0373  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1205  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  43.56 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3722  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 635 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.940611  normal  0.125775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2421  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.42 
 
 		 684 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243595 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  42.04 
 
 		 221 aa  172  5.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 224 aa  171  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03590  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  39.21 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0594239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  40 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 232 aa  169  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  42.67 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  38.53 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  37.66 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1012  DNA-binding response regulator  41.85 
 
 		 222 aa  169  5e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  40.79 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 224 aa  168  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.26 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 799 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 235 aa  168  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 226 aa  168  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 226 aa  168  8e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 227 aa  168  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.72 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2301  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.04 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205811  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  38.94 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  38.56 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  37.66 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  37.66 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  40.44 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 225 aa  166  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3246  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 231 aa  164  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000050319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  40.09 
 
 		 253 aa  164  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0242  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 238 aa  164  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 223 aa  164  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 		 283 aa  164  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3908  two component transcriptional regulator  43.29 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.487109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>