More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0950 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1544  two component transcriptional regulator, winged helix family  92.86 
 
 		 237 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.91 
 
 		 231 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.91 
 
 		 231 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1142  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.65 
 
 		 227 aa  281  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5305  winged helix family two component transcriptional regulator  56.78 
 
 		 244 aa  280  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217359  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2647  response regulator receiver domain-containing protein  53.7 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  45.27 
 
 		 236 aa  184  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5187  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000511147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3923  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.05 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 283 aa  181  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 222 aa  181  8.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 652 aa  181  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2027  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1236  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 224 aa  175  7e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  41.3 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0691  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2453  winged helix family two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 799 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  40.35 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.45 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.61 
 
 		 635 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  42.55 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  42.29 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 224 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  41.41 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 224 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  40.53 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3722  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 635 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.940611  normal  0.125775 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  41.41 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  41.33 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.4 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0286  two component transcriptional regulator  40.61 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  41.28 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  41.48 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  39.08 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 224 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1723  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 597 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000776738 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0705  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.72 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591946 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  40.97 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  40.97 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0702  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.57 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.149482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1213  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.7 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03590  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  37.55 
 
 		 226 aa  161  9e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0594239 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  39.21 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0003  response regulator receiver  40.69 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  40.53 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.99 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1132  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.17 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  37.24 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1596  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.74 
 
 		 238 aa  159  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 220 aa  158  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1186  winged helix family two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>