More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0691 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0691  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 227 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5187  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.64 
 
 		 228 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000511147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  64.55 
 
 		 224 aa  299  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3923  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.78 
 
 		 224 aa  271  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1142  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2453  winged helix family two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.58 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 222 aa  175  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1544  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 652 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.66 
 
 		 224 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2027  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.6 
 
 		 240 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 224 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2647  response regulator receiver domain-containing protein  46.12 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5305  winged helix family two component transcriptional regulator  44.17 
 
 		 244 aa  170  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  43.52 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  41.28 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  38.01 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1208  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1012  DNA-binding response regulator  38.64 
 
 		 222 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  39.37 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  39.37 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  34.53 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.69 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 255 aa  162  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.17 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  38.53 
 
 		 224 aa  161  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  42.92 
 
 		 226 aa  161  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.24 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 240 aa  161  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2305  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 228 aa  161  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.99 
 
 		 224 aa  161  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  42.47 
 
 		 228 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 283 aa  160  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.27 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 227 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.27 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.16 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.27 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.64 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  39.38 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 1629 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.84 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.7 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.93 
 
 		 235 aa  158  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.79 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  35.84 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 224 aa  158  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.7 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.55 
 
 		 231 aa  158  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  39.55 
 
 		 253 aa  157  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  39.45 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 		 799 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0353  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  38.67 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0834  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.09 
 
 		 265 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0108417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1599  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118902  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  38.77 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.68 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  37.73 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.15 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.68 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  37.27 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4548  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 		 614 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>