More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2305 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2305  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.96 
 
 		 226 aa  304  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.07 
 
 		 225 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.07 
 
 		 225 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2453  winged helix family two component transcriptional regulator  67.41 
 
 		 236 aa  296  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  66.96 
 
 		 236 aa  293  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2027  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.92 
 
 		 240 aa  278  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  61.06 
 
 		 229 aa  278  6e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1142  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.03 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  47.14 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  44.05 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2647  response regulator receiver domain-containing protein  50.24 
 
 		 224 aa  185  7e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5187  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000511147 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5305  winged helix family two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217359  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  42.54 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 224 aa  181  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0691  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 224 aa  180  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 235 aa  178  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 228 aa  175  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  40.59 
 
 		 246 aa  174  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 227 aa  174  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  42.29 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0708  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.61 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328024  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  42.79 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  42.34 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3923  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.34 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.69 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0402  transcriptional activator IrlR  43.42 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0800763  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1028  DNA-binding response regulator IrlR  43.42 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0282692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1439  transcriptional activator IrlR  43.42 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0030  DNA-binding response regulator IrlR  43.42 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1180  transcriptional activator IrlR  43.42 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0831411  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1524  transcriptional activator protein IrlR  43.42 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0010  transcriptional activator IrlR  43.42 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121051  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 235 aa  171  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 235 aa  171  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 283 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.24 
 
 		 224 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.59 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.18 
 
 		 238 aa  171  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.59 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.59 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.69 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  42.67 
 
 		 257 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.14 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.14 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.36 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  40.89 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2430  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.59 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  39.29 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>