More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2027 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2027  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.18 
 
 		 226 aa  295  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.6 
 
 		 225 aa  292  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.6 
 
 		 225 aa  292  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  61.67 
 
 		 236 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2453  winged helix family two component transcriptional regulator  63.6 
 
 		 236 aa  283  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  60.08 
 
 		 229 aa  268  5e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2305  two component transcriptional regulator  60.92 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 240 aa  201  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5305  winged helix family two component transcriptional regulator  43.55 
 
 		 244 aa  199  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217359  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.37 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5187  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.03 
 
 		 228 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000511147 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  41.95 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1142  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.23 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  41.95 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  41.95 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  188  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  41.1 
 
 		 224 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  41.1 
 
 		 224 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  46.84 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  46.41 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  46.03 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.73 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.99 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2647  response regulator receiver domain-containing protein  48.21 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  40.76 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  46.41 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  41.95 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 238 aa  177  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.37 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.37 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 235 aa  175  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1713  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.83 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1544  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.68 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  42.74 
 
 		 232 aa  175  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  40.56 
 
 		 246 aa  174  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3923  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 224 aa  174  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  42.26 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.45 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  44.73 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  44.73 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  44.73 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  46.41 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.17 
 
 		 224 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  41.1 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.13 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0691  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.6 
 
 		 227 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  39.33 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.49 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 231 aa  171  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.53 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.41 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.16 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.59 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.31 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.45 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  38.75 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 799 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  40.25 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.14 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  38.56 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.71 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  41.42 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5331  transcriptional regulator two components regulatory system  39.92 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  38.56 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  40.42 
 
 		 1629 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.71 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  43.16 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  39.41 
 
 		 224 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.95 
 
 		 223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>