More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4085 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.71 
 
 		 224 aa  308  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.07 
 
 		 224 aa  305  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.07 
 
 		 224 aa  304  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  58.37 
 
 		 1629 aa  279  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.59 
 
 		 226 aa  275  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.14 
 
 		 225 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.14 
 
 		 225 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.05 
 
 		 224 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2421  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  59.01 
 
 		 684 aa  258  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  54.95 
 
 		 652 aa  255  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  51.34 
 
 		 799 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4228  winged helix family two component transcriptional regulator  53.54 
 
 		 509 aa  237  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.290807  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0298  winged helix family two component transcriptional regulator  60.54 
 
 		 230 aa  236  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.88518  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 635 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3722  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 635 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.940611  normal  0.125775 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0163  multi-component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 725 aa  227  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.892768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4548  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 614 aa  224  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1723  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 597 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000776738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1629  multi-component transcriptional regulator  52.47 
 
 		 613 aa  208  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.84 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 231 aa  194  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2647  response regulator receiver domain-containing protein  47.87 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 222 aa  188  5.999999999999999e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  47.09 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  43.97 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 238 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1544  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1142  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0436  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 236 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 240 aa  181  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 283 aa  181  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 250 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  42.47 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.09 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5305  winged helix family two component transcriptional regulator  41.35 
 
 		 244 aa  175  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217359  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 219 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  42.66 
 
 		 219 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  40.09 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  41.63 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 220 aa  174  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  41.78 
 
 		 253 aa  174  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2453  winged helix family two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 236 aa  174  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.79 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  37.99 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3908  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  42.08 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0717  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12431  two-component response regulator, phosphate  41.3 
 
 		 242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  37.55 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  41.44 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  41.96 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2027  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.33 
 
 		 240 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 224 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 219 aa  171  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 236 aa  171  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  43.95 
 
 		 229 aa  171  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  39.37 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>