More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1602 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  89.24 
 
 		 223 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  78.08 
 
 		 223 aa  351  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  73.61 
 
 		 219 aa  327  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4961  two component transcriptional regulator  74.09 
 
 		 220 aa  315  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 219 aa  305  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3284  two component transcriptional regulator  70.78 
 
 		 219 aa  305  5.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0910618 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  70.05 
 
 		 225 aa  304  6e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  68.06 
 
 		 221 aa  297  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  67.59 
 
 		 221 aa  294  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  67.59 
 
 		 221 aa  293  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  63.43 
 
 		 219 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  62.96 
 
 		 219 aa  280  9e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0903  DNA-binding response regulator  68.52 
 
 		 219 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.604027  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0784  DNA-binding response regulator  69.44 
 
 		 219 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.42757  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1977  DNA-binding response regulator  69.44 
 
 		 219 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0490  two component response regulator  69.44 
 
 		 219 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663456  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2074  DNA-binding response regulator  69.44 
 
 		 219 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.401565  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1624  DNA-binding response regulator  69.44 
 
 		 219 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0176162  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0671  DNA-binding response regulator  69.44 
 
 		 219 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.485657  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0559  DNA-binding response regulator  69.44 
 
 		 232 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5168  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  67.13 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5392  winged helix family two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 219 aa  268  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  56.82 
 
 		 220 aa  264  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  56.56 
 
 		 222 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  56.36 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0124  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.45 
 
 		 220 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.0356027 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  51.36 
 
 		 220 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.82 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  52.31 
 
 		 220 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.18 
 
 		 220 aa  209  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  51.82 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  48.43 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 279 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  49.54 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3285  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00225391  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1953  two component transcriptional regulator  52.78 
 
 		 226 aa  198  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1754  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.78 
 
 		 226 aa  198  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1075  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  198  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 220 aa  198  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.53 
 
 		 219 aa  197  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 235 aa  197  9e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0471  two component transcriptional regulator  53.85 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3443  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 213 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3871  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 230 aa  194  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3456  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 220 aa  194  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.836579  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4243  response regulator receiver  49.07 
 
 		 219 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.376113 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 242 aa  194  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 219 aa  194  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  51.87 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  51.87 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  51.87 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  51.87 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  51.87 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  52.34 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  47.73 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  51.87 
 
 		 220 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  51.87 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  47.27 
 
 		 221 aa  191  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  51.87 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2154  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 218 aa  191  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2733  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00185097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  50.93 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  51.42 
 
 		 283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.26 
 
 		 218 aa  188  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2190  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3491  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3965  two component transcriptional regulator  50.93 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4876  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 221 aa  187  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.292661  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  44.95 
 
 		 219 aa  187  9e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.95 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  50.94 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  46.73 
 
 		 221 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1143  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.606905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  44.95 
 
 		 219 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.12 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.12 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4906  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.12 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3148  two component response regulator  51.9 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.174373  hitchhiker  0.000575412 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3124  transcriptional regulatory protein QseB  46.15 
 
 		 221 aa  185  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0622  DNA-binding response regulator  45.62 
 
 		 224 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4829  DNA-binding response regulator  47.47 
 
 		 235 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00101292  normal  0.0130353 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1414  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0688  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  47 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4632  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.920872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1465  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  46.54 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>