More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2752 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 799 aa  1637    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1629  multi-component transcriptional regulator  42.56 
 
 		 613 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4548  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  41.51 
 
 		 614 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1723  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 597 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000776738 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.97 
 
 		 635 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3722  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.81 
 
 		 635 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.940611  normal  0.125775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.28 
 
 		 676 aa  364  4e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3505  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.43 
 
 		 665 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 1629 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2421  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.26 
 
 		 684 aa  323  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  37.43 
 
 		 652 aa  309  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0151  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.3 
 
 		 796 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0705209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4228  winged helix family two component transcriptional regulator  36 
 
 		 509 aa  273  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.290807  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.71 
 
 		 224 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.36 
 
 		 224 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.7 
 
 		 226 aa  267  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.91 
 
 		 224 aa  265  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.81 
 
 		 225 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.81 
 
 		 225 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0163  multi-component transcriptional regulator  34.58 
 
 		 725 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.892768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  51.34 
 
 		 225 aa  253  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.57 
 
 		 224 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0841  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.34 
 
 		 715 aa  216  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1484  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.92 
 
 		 555 aa  214  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.32 
 
 		 234 aa  210  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4315  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.95 
 
 		 554 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.554314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3442  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.66 
 
 		 539 aa  208  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.677434  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0298  winged helix family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 230 aa  202  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.88518  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.74 
 
 		 941 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 225 aa  197  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2212  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.71 
 
 		 543 aa  191  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 231 aa  190  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 231 aa  189  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  43.84 
 
 		 219 aa  184  5.0000000000000004e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 224 aa  184  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1554  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31 
 
 		 419 aa  184  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  43.89 
 
 		 231 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 240 aa  184  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 222 aa  183  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 224 aa  181  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 254 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 236 aa  179  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 227 aa  179  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 227 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 227 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 223 aa  179  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 232 aa  178  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3908  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 227 aa  178  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 227 aa  177  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 223 aa  177  6e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0623  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.96 
 
 		 556 aa  177  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 283 aa  177  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 225 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 224 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  36.99 
 
 		 246 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4377  GGDEF  27.29 
 
 		 551 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4602  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.03 
 
 		 459 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.195913 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2127  response regulator  28.24 
 
 		 544 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 220 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0608  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.79 
 
 		 452 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597995 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2087  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 544 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1887  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 544 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0602  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.62 
 
 		 451 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.78 
 
 		 308 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1169  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.78 
 
 		 308 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1039  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.33 
 
 		 393 aa  174  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0950507  normal  0.205042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4837  response regulator  28.05 
 
 		 551 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.978785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0723  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.86 
 
 		 540 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0563  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.62 
 
 		 451 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2695  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 226 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000581772  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 224 aa  174  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 222 aa  174  9e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4025  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 227 aa  174  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 236 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  173  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 235 aa  173  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 220 aa  173  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  40.09 
 
 		 219 aa  173  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 230 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  40.53 
 
 		 237 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 		 226 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  39.29 
 
 		 219 aa  172  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 230 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 230 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 220 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3852  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 231 aa  172  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15775  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 225 aa  172  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0282  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.53 
 
 		 230 aa  172  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0932199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 231 aa  172  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 231 aa  171  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 238 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3353  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 225 aa  171  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371413  normal  0.100473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3670  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.04 
 
 		 561 aa  171  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 227 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  40.81 
 
 		 223 aa  171  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 227 aa  171  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 224 aa  171  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 223 aa  170  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 228 aa  170  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3303  response regulator receiver protein  40.99 
 
 		 224 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>