More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0705 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0705  two component heavy metal response transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591946 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1596  two component heavy metal response transcriptional regulator  90.12 
 
 		 238 aa  441  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0702  two component heavy metal response transcriptional regulator  93.89 
 
 		 238 aa  433  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.149482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  60.99 
 
 		 228 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  60.54 
 
 		 228 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  60.54 
 
 		 228 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00315  probable two component response regulator transcription regulator protein  59.91 
 
 		 227 aa  283  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.89 
 
 		 227 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.64 
 
 		 225 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  59.19 
 
 		 228 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.74 
 
 		 230 aa  278  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  59.19 
 
 		 226 aa  277  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  56.64 
 
 		 226 aa  276  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  58.3 
 
 		 228 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  59.64 
 
 		 228 aa  275  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2490  heavy metal response regulator  60.44 
 
 		 228 aa  275  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289616  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.09 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  55.31 
 
 		 226 aa  271  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.27 
 
 		 225 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.27 
 
 		 225 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.27 
 
 		 225 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.95 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.5 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3426  DNA-binding transcriptional activator CusR  57.85 
 
 		 226 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.19 
 
 		 242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.5 
 
 		 226 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6111  regulator protein CopR  59.19 
 
 		 228 aa  268  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110686  normal  0.158568 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5672  DNA-binding response regulator  60.71 
 
 		 228 aa  268  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0258  DNA-binding transcriptional activator CusR  57.4 
 
 		 226 aa  267  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00532  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CusS  57.4 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  57.4 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  57.4 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  57.4 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  57.4 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2430  two component heavy metal response transcriptional regulator  58.3 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  57.4 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  57.4 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  57.4 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4296  DNA-binding transcriptional activator CusR  56.95 
 
 		 226 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000252174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.95 
 
 		 223 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.95 
 
 		 227 aa  265  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.95 
 
 		 223 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.95 
 
 		 223 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  55.16 
 
 		 225 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3842  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.85 
 
 		 227 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4683  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.85 
 
 		 228 aa  264  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222547  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3680  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.85 
 
 		 228 aa  264  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1208  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  58.3 
 
 		 226 aa  264  8e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6173  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.85 
 
 		 228 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  55.61 
 
 		 223 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0376  DNA-binding response regulator IrlR  55.16 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.083776  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.5 
 
 		 223 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2869  transcriptional activator protein IrlR  55.16 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.354021  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2716  DNA-binding heavy metal response regulator  55.16 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558922  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  54.71 
 
 		 228 aa  261  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1103  DNA-binding response regulator IrlR  55.16 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0630149  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.89 
 
 		 223 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  56.25 
 
 		 225 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2234  two component heavy metal response transcriptional regulator  57.4 
 
 		 225 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.162422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1742  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  57.85 
 
 		 228 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.595604 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1028  DNA-binding response regulator IrlR  55.61 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0282692  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0030  DNA-binding response regulator IrlR  55.61 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1524  transcriptional activator protein IrlR  55.61 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0402  transcriptional activator IrlR  55.61 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0800763  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0010  transcriptional activator IrlR  55.61 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121051  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.05 
 
 		 227 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1439  transcriptional activator IrlR  55.61 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1180  transcriptional activator IrlR  55.61 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0831411  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  56.25 
 
 		 225 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.05 
 
 		 226 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.05 
 
 		 223 aa  258  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4389  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  55.16 
 
 		 226 aa  258  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  54.71 
 
 		 228 aa  258  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  55.61 
 
 		 226 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1376  DNA-binding response regulator IrlR  54.71 
 
 		 229 aa  257  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.498923  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2165  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  56.05 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.77286 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  55.61 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  54.71 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  56.5 
 
 		 224 aa  256  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2768  two component heavy metal response transcriptional regulator  56.5 
 
 		 223 aa  254  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0197  transcriptional activator protein, response regulator  53.33 
 
 		 227 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0086442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  54.71 
 
 		 226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1510  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  55.61 
 
 		 227 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2960  two component heavy metal response transcriptional regulator  54.26 
 
 		 227 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0708  two component heavy metal response transcriptional regulator  53.81 
 
 		 226 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328024  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  55.16 
 
 		 225 aa  250  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  54.71 
 
 		 224 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  53.62 
 
 		 229 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0102  two component heavy metal response transcriptional regulator  55.16 
 
 		 223 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.753235  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  55.8 
 
 		 225 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  55.8 
 
 		 225 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  55.8 
 
 		 225 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  54.71 
 
 		 225 aa  248  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  55.36 
 
 		 225 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  54.71 
 
 		 224 aa  248  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3722  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  53.98 
 
 		 223 aa  248  8e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  54.91 
 
 		 225 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  50.22 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2725  two component heavy metal response transcriptional regulator  53.36 
 
 		 227 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>