More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1723 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1723  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 597 aa  1211    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000776738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1629  multi-component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 613 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  38.8 
 
 		 799 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4548  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  38.56 
 
 		 614 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.61 
 
 		 635 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3722  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 		 635 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.940611  normal  0.125775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2421  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.48 
 
 		 684 aa  266  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  35.67 
 
 		 1629 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  33.27 
 
 		 652 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0163  multi-component transcriptional regulator  37.57 
 
 		 725 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.892768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 225 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 225 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 		 224 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 		 224 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 226 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 225 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 224 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4228  winged helix family two component transcriptional regulator  34.72 
 
 		 509 aa  217  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.290807  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 224 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 		 234 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0298  winged helix family two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 230 aa  179  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.88518  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0151  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.28 
 
 		 796 aa  178  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0705209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 224 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 232 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 224 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 225 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  38.74 
 
 		 221 aa  173  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3505  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.61 
 
 		 665 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 227 aa  171  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 222 aa  171  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  170  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  37.66 
 
 		 237 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 233 aa  167  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 230 aa  167  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 225 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  38.12 
 
 		 223 aa  167  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 224 aa  166  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 227 aa  166  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 		 222 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 231 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 283 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.15 
 
 		 676 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.66 
 
 		 231 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 227 aa  164  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 231 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 231 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 231 aa  163  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 240 aa  163  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 230 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 230 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 235 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 223 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 230 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 238 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 224 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 236 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1205  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 222 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 224 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1544  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 237 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03590  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  38.77 
 
 		 226 aa  161  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0594239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1132  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  41.05 
 
 		 227 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 226 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 226 aa  160  6e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 227 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 227 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  39.01 
 
 		 219 aa  160  8e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  38.29 
 
 		 225 aa  160  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  38.16 
 
 		 223 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.72 
 
 		 228 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 224 aa  159  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 246 aa  159  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.4 
 
 		 232 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 224 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 227 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 		 225 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 		 225 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 257 aa  158  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.91 
 
 		 235 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 224 aa  158  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  37.56 
 
 		 219 aa  157  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 236 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 232 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 237 aa  157  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2647  response regulator receiver domain-containing protein  38.86 
 
 		 224 aa  156  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 		 226 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.47 
 
 		 242 aa  156  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 225 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5305  winged helix family two component transcriptional regulator  39.24 
 
 		 244 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217359  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 225 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 229 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 224 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  38.57 
 
 		 253 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  36.73 
 
 		 224 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 224 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2301  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 225 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205811  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 224 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5187  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 228 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000511147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 231 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.47 
 
 		 242 aa  154  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>