More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2301 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2301  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205811  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  52.7 
 
 		 223 aa  244  6e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1236  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.44 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  51.35 
 
 		 227 aa  223  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.73 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03590  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  47.73 
 
 		 226 aa  213  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0594239 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  45.5 
 
 		 224 aa  207  8e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0710  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00420398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0373  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  45 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  44.55 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  44.55 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  44.09 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  44.09 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.84 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 240 aa  191  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  42.01 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  41.96 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 229 aa  182  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  40.99 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  40.44 
 
 		 253 aa  181  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0627  DNA-binding response regulator  39.73 
 
 		 223 aa  181  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0608  DNA-binding response regulator  39.73 
 
 		 223 aa  181  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0634  DNA-binding response regulator  39.29 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0485  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  44.14 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  43.69 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0540  DNA-binding response regulator  39.29 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0484  response regulator  39.29 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0571  DNA-binding response regulator  39.29 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0482  response regulator  38.84 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4731  DNA-binding response regulator  39.29 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0702  DNA-binding response regulator  38.84 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 273 aa  178  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 226 aa  177  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23930  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.1 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00212671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1328  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00114355  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  43.18 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  39.47 
 
 		 252 aa  175  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 225 aa  174  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 224 aa  174  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  39.19 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  42.08 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  41.82 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  39.3 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0286  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1544  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  38.5 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6599  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  38.94 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 236 aa  170  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  41.89 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  38.05 
 
 		 236 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>