More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6599 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6599  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2463  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.25 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2516  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.6 
 
 		 223 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.492015 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 		 223 aa  224  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1393  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0533398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7229  two-component response regulator  44.55 
 
 		 229 aa  177  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  40.36 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 227 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3934  DNA-binding response regulator  42.34 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3471  putative two-component response regulator  41.82 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 233 aa  168  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4950  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.05 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2913  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 227 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3715  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3296  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1280  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  39.55 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2172  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2454  transcriptional regulator domain protein  37.05 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.02572  normal  0.811367 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1236  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1128  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  36.77 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.40399  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3281  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3603  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 224 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3392  response regulator transcription regulator protein  40.18 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1364  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2759  two-component response regulator  39.55 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2301  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.28 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32580  two-component response regulator  39.55 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2065  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0454664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  39.46 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2580  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 222 aa  155  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 229 aa  154  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.77 
 
 		 248 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1075  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2264  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.664043  normal  0.0314152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2423  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 234 aa  154  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.265311  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 222 aa  154  9e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 283 aa  154  9e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0727  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  154  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0746  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  36.94 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  37.95 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  39.46 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  40 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  40 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  40 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.64 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  40.45 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2017  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.406269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  40 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  40 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0286  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.61 
 
 		 218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  40 
 
 		 287 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  39.64 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.05 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 221 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  34.98 
 
 		 223 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.12 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>