More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1236 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1236  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03590  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  48.2 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0594239 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  47.98 
 
 		 223 aa  218  7.999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2301  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.66 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0373  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 237 aa  208  7e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.32 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0608  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1544  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0484  response regulator  42.22 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0485  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0634  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0482  response regulator  42.22 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0627  DNA-binding response regulator  42.67 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0702  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  42.34 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0540  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4731  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0571  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  44.14 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  43.69 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  41.96 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  42.15 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 220 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 240 aa  175  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 223 aa  174  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  41.7 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0710  DNA-binding response regulator  41.44 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00420398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  41.7 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1142  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  40.09 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  41.7 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  41.7 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  41.36 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.24 
 
 		 223 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.99 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 283 aa  170  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  40.62 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  39.46 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0985  DNA-binding response regulator CiaR  40.62 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.447626  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  40.36 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 229 aa  169  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  39.74 
 
 		 237 aa  168  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1810  DNA-binding response regulator  39.46 
 
 		 233 aa  168  5e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0562957  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0286  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 227 aa  168  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 223 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3923  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  41.82 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  43.24 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 230 aa  165  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 231 aa  165  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 220 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 230 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 230 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>