More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2765 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 221 aa  420  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  87.67 
 
 		 221 aa  371  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2264  two component transcriptional regulator  60.73 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.664043  normal  0.0314152 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  54.3 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  54.3 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  53.85 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 		 224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 		 224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 		 224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  52.49 
 
 		 267 aa  215  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.97 
 
 		 230 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  52.04 
 
 		 252 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  52.04 
 
 		 252 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  52.04 
 
 		 223 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  55.41 
 
 		 223 aa  213  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  52.04 
 
 		 252 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  52.04 
 
 		 252 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.14 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  52.04 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  51.6 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 		 235 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  52.05 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.77 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  51.14 
 
 		 266 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  51.14 
 
 		 247 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  52.27 
 
 		 247 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  52.27 
 
 		 250 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  54.5 
 
 		 223 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  52.27 
 
 		 247 aa  208  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  52.27 
 
 		 247 aa  208  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  52.27 
 
 		 247 aa  208  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 252 aa  208  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 242 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 242 aa  207  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 242 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 282 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 282 aa  207  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  50.68 
 
 		 291 aa  207  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  54.5 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3169  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.121131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  54.05 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  52.7 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 273 aa  204  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  51.13 
 
 		 226 aa  203  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  52.25 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.51 
 
 		 224 aa  201  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  53.15 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  53.15 
 
 		 223 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.92 
 
 		 225 aa  201  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 		 223 aa  201  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.14 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  52.25 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.4 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 221 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.49 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 226 aa  197  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  48.61 
 
 		 221 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.49 
 
 		 225 aa  197  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  52.7 
 
 		 223 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  48.61 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  48.4 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.32 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0286  response regulator receiver protein  46.58 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0550  response regulator transcription regulator protein  51.8 
 
 		 232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.837595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0310  DNA-binding transcriptional regulator BasR  46.33 
 
 		 232 aa  194  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214332  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  51.36 
 
 		 223 aa  195  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 223 aa  195  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  47.27 
 
 		 224 aa  192  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3585  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4259  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  48.17 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0310  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 223 aa  191  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3340  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  47.03 
 
 		 219 aa  191  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1045  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0254823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  45.91 
 
 		 220 aa  188  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>