More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6288 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  61.36 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.91 
 
 		 260 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  60.54 
 
 		 266 aa  264  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  60.91 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  60.45 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  60.45 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  60.45 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  60.45 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  60.45 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  60.27 
 
 		 223 aa  262  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  60.45 
 
 		 247 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  60.45 
 
 		 282 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  60.45 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  60.45 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  60.45 
 
 		 242 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  60 
 
 		 247 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  60.45 
 
 		 273 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  60 
 
 		 291 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  59.09 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  58.18 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.95 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.95 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.56 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  55.91 
 
 		 223 aa  238  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  55.45 
 
 		 223 aa  237  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  54.75 
 
 		 223 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  54.75 
 
 		 224 aa  228  8e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  55.66 
 
 		 224 aa  228  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0550  response regulator transcription regulator protein  58.3 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.837595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  55.2 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.2 
 
 		 223 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.66 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  55.66 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  53.88 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  53.85 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  53.88 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  54.79 
 
 		 223 aa  221  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  53.88 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  54.79 
 
 		 287 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  54.79 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  54.79 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  54.79 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  54.79 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  54.34 
 
 		 267 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  53.42 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  54.3 
 
 		 226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  53.42 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  53.42 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  53.92 
 
 		 222 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  54.09 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  52.75 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  53.64 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4078  DNA-binding response regulator  50.68 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0729773  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1619  DNA-binding response regulator  50.68 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2924  DNA-binding response regulator  50.68 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0208  DNA-binding response regulator  50.68 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3339  DNA-binding response regulator  50.68 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3386  DNA-binding response regulator  50.68 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4004  DNA-binding response regulator  50.68 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2983  DNA-binding response regulator  50.68 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  52.29 
 
 		 223 aa  211  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3389  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0074  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.948307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3256  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0075  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0093  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0075  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2980  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0066  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0008  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3924  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.49 
 
 		 220 aa  208  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3057  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 228 aa  207  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3228  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.3 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3535  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3552  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.3 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  52.91 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  52.47 
 
 		 223 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3169  two component transcriptional regulator  51.14 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.121131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  52.94 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 231 aa  202  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.51 
 
 		 221 aa  201  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 219 aa  202  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1190  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 227 aa  202  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  51.6 
 
 		 220 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  48 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  52.05 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.08 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  48.62 
 
 		 239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.77 
 
 		 218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  50.67 
 
 		 223 aa  198  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1045  two component transcriptional regulator  53.42 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0254823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.62 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2897  DNA-binding response regulator TctD  46.49 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  52.05 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>