More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0550 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0550  response regulator transcription regulator protein  100 
 
 		 232 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.837595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  94.2 
 
 		 235 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  94.17 
 
 		 236 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  83.62 
 
 		 229 aa  384  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  83.55 
 
 		 229 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  77.92 
 
 		 266 aa  361  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  80.8 
 
 		 282 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  80.8 
 
 		 282 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  81.25 
 
 		 252 aa  359  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  80.8 
 
 		 242 aa  358  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  80.8 
 
 		 242 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  80.8 
 
 		 242 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  80.36 
 
 		 273 aa  357  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  79.37 
 
 		 260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  79.82 
 
 		 253 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  78.17 
 
 		 247 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  78.17 
 
 		 247 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  78.17 
 
 		 250 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  78.17 
 
 		 247 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  78.17 
 
 		 247 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  78.17 
 
 		 247 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  78.92 
 
 		 291 aa  350  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  73.21 
 
 		 223 aa  331  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  74.11 
 
 		 224 aa  328  5.0000000000000004e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  75 
 
 		 224 aa  327  7e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  75 
 
 		 224 aa  327  8e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  73.66 
 
 		 223 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  70.22 
 
 		 223 aa  324  7e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  73.78 
 
 		 224 aa  324  7e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  72 
 
 		 224 aa  321  7e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  72.57 
 
 		 226 aa  320  9.000000000000001e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  71.88 
 
 		 224 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.43 
 
 		 223 aa  317  9e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  73.09 
 
 		 223 aa  315  6e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.83 
 
 		 230 aa  295  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.3 
 
 		 224 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  55.86 
 
 		 230 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  55.16 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  53.6 
 
 		 226 aa  222  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  54.05 
 
 		 267 aa  222  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  54.15 
 
 		 229 aa  221  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  54.05 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  54.05 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  52.65 
 
 		 224 aa  221  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  54.05 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  54.05 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  52.65 
 
 		 224 aa  221  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  54.05 
 
 		 287 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  54.05 
 
 		 223 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  54.5 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  52.7 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  52.7 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  54.5 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  54.26 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  52.7 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1190  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.6 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.47 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  53.95 
 
 		 226 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  53.64 
 
 		 222 aa  215  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.36 
 
 		 221 aa  214  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  53.15 
 
 		 223 aa  214  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.22 
 
 		 218 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  47.11 
 
 		 232 aa  211  5.999999999999999e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  52.25 
 
 		 223 aa  211  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  46.67 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  51.35 
 
 		 223 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  51.8 
 
 		 223 aa  207  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 225 aa  207  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3169  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.121131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2264  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 221 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.664043  normal  0.0314152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 221 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 225 aa  204  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 223 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 220 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  47.77 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 222 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 222 aa  201  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  52.44 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  51.56 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  52.94 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  52.94 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  52.94 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  52.94 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  52.94 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3340  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2897  DNA-binding response regulator TctD  47.98 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3084  transcriptional regulator TctD  47.98 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 221 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2981  transcriptional regulator TctD  47.98 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.510212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>