More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0498 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  441  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  89.24 
 
 		 223 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  82.96 
 
 		 224 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  81.7 
 
 		 224 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  82.51 
 
 		 223 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  81.25 
 
 		 224 aa  367  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  81.53 
 
 		 224 aa  364  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  81.17 
 
 		 224 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  81.17 
 
 		 223 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  80.63 
 
 		 224 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  81.61 
 
 		 226 aa  362  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  75.57 
 
 		 252 aa  344  6e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  75.45 
 
 		 229 aa  344  8e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  74.66 
 
 		 282 aa  342  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  74.66 
 
 		 282 aa  342  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  75 
 
 		 260 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  74.66 
 
 		 242 aa  341  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  75 
 
 		 253 aa  341  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  74.66 
 
 		 242 aa  341  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  74.66 
 
 		 242 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  74.66 
 
 		 229 aa  341  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  74.21 
 
 		 273 aa  340  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  74.55 
 
 		 266 aa  340  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  75 
 
 		 247 aa  339  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  74.09 
 
 		 247 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  74.09 
 
 		 250 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  74.09 
 
 		 291 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  74.09 
 
 		 247 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  74.09 
 
 		 247 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  74.09 
 
 		 247 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.88 
 
 		 235 aa  326  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.2 
 
 		 236 aa  325  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0550  response regulator transcription regulator protein  73.21 
 
 		 232 aa  308  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.837595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  69.51 
 
 		 223 aa  299  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.45 
 
 		 230 aa  285  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.45 
 
 		 224 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  52.47 
 
 		 267 aa  225  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  52.02 
 
 		 252 aa  224  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  52.25 
 
 		 223 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  52.02 
 
 		 252 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  52.02 
 
 		 252 aa  224  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  52.02 
 
 		 252 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  52.02 
 
 		 287 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  52.91 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  52.27 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1190  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.68 
 
 		 227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  52.05 
 
 		 224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 		 226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  52.05 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.36 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 239 aa  215  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 		 225 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.91 
 
 		 218 aa  214  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 230 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  51.15 
 
 		 222 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  49.55 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  48.86 
 
 		 223 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  48.86 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3169  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 266 aa  208  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.121131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  51.8 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  50.45 
 
 		 223 aa  204  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  53.18 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  52.73 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  52.73 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  47.3 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 224 aa  202  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  48.42 
 
 		 221 aa  202  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 		 223 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  46.85 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  51.82 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 		 223 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.09 
 
 		 221 aa  201  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  51.82 
 
 		 220 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.76 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  51.82 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  51.82 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  51.82 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  51.82 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  51.82 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2264  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.664043  normal  0.0314152 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.16 
 
 		 229 aa  198  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>