More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1037 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  100 
 
 
287 aa  497  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  100 
 
 
252 aa  497  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  100 
 
 
252 aa  497  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  100 
 
 
252 aa  497  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  100 
 
 
252 aa  497  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  100 
 
 
223 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  96.51 
 
 
267 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  90.5 
 
 
224 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  90.5 
 
 
224 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  92.24 
 
 
222 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  90.5 
 
 
226 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  90.95 
 
 
224 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  90.5 
 
 
224 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  90.5 
 
 
224 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  75.34 
 
 
230 aa  334  9e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1045  two component transcriptional regulator  81.61 
 
 
223 aa  328  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0254823  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  74.89 
 
 
226 aa  316  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1736  two-component response regulator transcription regulator protein  72.65 
 
 
230 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151156  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  61.71 
 
 
223 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  61.26 
 
 
223 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  62.44 
 
 
223 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  61.26 
 
 
223 aa  251  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  60.27 
 
 
223 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  59.73 
 
 
223 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  60.18 
 
 
223 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  60.27 
 
 
223 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  60.27 
 
 
223 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  59.82 
 
 
223 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  58.82 
 
 
223 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  54.34 
 
 
239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  57.53 
 
 
223 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3281  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.59 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3603  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.59 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.79 
 
 
230 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  54.91 
 
 
229 aa  232  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  55.45 
 
 
221 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.59 
 
 
222 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3340  two component transcriptional regulator  56.16 
 
 
224 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  54.22 
 
 
266 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.59 
 
 
222 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.77 
 
 
229 aa  228  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3958  two component transcriptional regulator  54.3 
 
 
237 aa  228  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  55.5 
 
 
222 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0496  two component transcriptional regulator  55.5 
 
 
225 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569564  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  54.3 
 
 
225 aa  227  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  55.36 
 
 
282 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  54.02 
 
 
229 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4036  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.05 
 
 
225 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  55.36 
 
 
273 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3392  response regulator transcription regulator protein  53.67 
 
 
224 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  55.61 
 
 
291 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  55.25 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3084  transcriptional regulator TctD  53.88 
 
 
224 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2928  transcriptional regulatory protein TctD  53.88 
 
 
224 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2964  transcriptional regulator TctD  53.88 
 
 
224 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000947102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 
223 aa  224  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2981  transcriptional regulator TctD  53.88 
 
 
224 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.510212 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  56.16 
 
 
252 aa  224  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.79 
 
 
260 aa  224  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2897  DNA-binding response regulator TctD  53.88 
 
 
224 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  55.91 
 
 
282 aa  224  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  53.36 
 
 
223 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  56.16 
 
 
242 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  56.16 
 
 
242 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  56.16 
 
 
242 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  55.36 
 
 
247 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3585  two component transcriptional regulator  52.91 
 
 
224 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  54.63 
 
 
250 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  53.42 
 
 
223 aa  222  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  54.91 
 
 
247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1364  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.55 
 
 
224 aa  221  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.79 
 
 
224 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  54.91 
 
 
247 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  54.91 
 
 
247 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 
236 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  54.91 
 
 
247 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 
235 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2401  two component transcriptional regulator  54.3 
 
 
227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3332  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.13 
 
 
221 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  51.82 
 
 
224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 
223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2935  putative response regulator transcription regulator protein  54.71 
 
 
235 aa  215  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  52.05 
 
 
224 aa  214  9e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2580  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 
231 aa  214  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3802  two component transcriptional regulator  52.05 
 
 
227 aa  214  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal  0.282515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
223 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 
224 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.04 
 
 
221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 
224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 
221 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  50 
 
 
224 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2865  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.64 
 
 
233 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3934  DNA-binding response regulator  51.6 
 
 
223 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3212  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.18 
 
 
233 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419022  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 
224 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0022  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
225 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1851  DNA-binding response regulator  49.77 
 
 
225 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0049  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
225 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>