More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1420 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  99.55 
 
 		 223 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  99.55 
 
 		 223 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  97.31 
 
 		 223 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  93.27 
 
 		 223 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  91.89 
 
 		 223 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  91.89 
 
 		 223 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  85.84 
 
 		 223 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  84.47 
 
 		 223 aa  362  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  81.17 
 
 		 223 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  80.09 
 
 		 223 aa  346  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  60.73 
 
 		 267 aa  249  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  57.21 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  60.27 
 
 		 223 aa  248  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  60.27 
 
 		 287 aa  248  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  60.27 
 
 		 252 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  60.27 
 
 		 252 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  60.27 
 
 		 252 aa  248  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  60.27 
 
 		 252 aa  248  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  59.28 
 
 		 226 aa  245  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  58.82 
 
 		 224 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  58.82 
 
 		 224 aa  244  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  57.92 
 
 		 226 aa  242  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  57.92 
 
 		 224 aa  241  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  57.92 
 
 		 224 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  57.92 
 
 		 224 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3340  two component transcriptional regulator  60.27 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  57.53 
 
 		 222 aa  235  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1045  two component transcriptional regulator  59.19 
 
 		 223 aa  231  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0254823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1364  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.99 
 
 		 224 aa  231  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2964  transcriptional regulator TctD  56.31 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2897  DNA-binding response regulator TctD  56.31 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3084  transcriptional regulator TctD  56.31 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2928  transcriptional regulatory protein TctD  56.31 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2981  transcriptional regulator TctD  56.31 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.510212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  51.82 
 
 		 223 aa  221  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  52.29 
 
 		 222 aa  218  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2580  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.25 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1736  two-component response regulator transcription regulator protein  58.64 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3585  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 		 224 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  52.97 
 
 		 225 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.25 
 
 		 235 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.25 
 
 		 236 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.91 
 
 		 229 aa  208  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  51.36 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.77 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.36 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  51.36 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.64 
 
 		 222 aa  205  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3958  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 229 aa  204  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2401  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 227 aa  204  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0039  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 225 aa  201  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4036  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 		 225 aa  201  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  49.08 
 
 		 221 aa  201  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2935  putative response regulator transcription regulator protein  52.97 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2676  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0042  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3276  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0255  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2701  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0042  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0496  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1851  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.15 
 
 		 221 aa  201  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3603  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3281  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1450  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.32 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 247 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 223 aa  198  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3332  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 221 aa  197  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 		 223 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  49.77 
 
 		 247 aa  197  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3212  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0030  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0040  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0049  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2865  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.35 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.176419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>