More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3359 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 231 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02407  two-component system regulatory protein  89.04 
 
 		 230 aa  391  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  81.74 
 
 		 231 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0286  response regulator receiver protein  81.28 
 
 		 231 aa  363  1e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  52.89 
 
 		 227 aa  238  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 221 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  50.91 
 
 		 223 aa  214  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.38 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 230 aa  211  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4432  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 222 aa  211  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 223 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.14 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 226 aa  208  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  46.61 
 
 		 223 aa  208  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.14 
 
 		 225 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6693  two component transcriptional regulator  51.13 
 
 		 221 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.64 
 
 		 223 aa  204  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 223 aa  204  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.62 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.17 
 
 		 218 aa  201  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4259  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 225 aa  201  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 222 aa  201  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 220 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  48.42 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0057  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  47.73 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3084  transcriptional regulator TctD  47.75 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2964  transcriptional regulator TctD  47.75 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2928  transcriptional regulatory protein TctD  47.75 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2981  transcriptional regulator TctD  47.75 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.510212 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  47.73 
 
 		 223 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2897  DNA-binding response regulator TctD  47.3 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 226 aa  198  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.66 
 
 		 260 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  47.73 
 
 		 287 aa  197  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 247 aa  197  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.49 
 
 		 221 aa  197  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  47.51 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  47.51 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.4 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3603  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.71 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  47.51 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  47.51 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3281  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.71 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  46.19 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  46.19 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0310  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 224 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 253 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1364  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3169  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.121131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1045  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 		 223 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0254823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 282 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 282 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 242 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 242 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 220 aa  194  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.5 
 
 		 222 aa  194  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 242 aa  194  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.95 
 
 		 222 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3392  response regulator transcription regulator protein  45.78 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2264  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 221 aa  193  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.664043  normal  0.0314152 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  46.12 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3340  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>