More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1307 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  100 
 
 
223 aa  450  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 
221 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3169  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.121131 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.42 
 
 
223 aa  213  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  48.43 
 
 
247 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  48.43 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  48.43 
 
 
250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  48.43 
 
 
247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  48.43 
 
 
247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  48.43 
 
 
247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 
253 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 
266 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.86 
 
 
260 aa  211  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 
273 aa  208  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 
252 aa  208  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
236 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
235 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  48.4 
 
 
291 aa  207  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 
282 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 
282 aa  207  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 
242 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 
242 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 
242 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 
223 aa  205  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 
224 aa  205  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 
229 aa  204  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 
226 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 
230 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 
223 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  47.27 
 
 
224 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.27 
 
 
224 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  49.32 
 
 
224 aa  202  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 
223 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.06 
 
 
229 aa  201  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 
223 aa  201  9e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 
224 aa  201  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 
229 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 
221 aa  198  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3981  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 
230 aa  198  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 
221 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.86 
 
 
225 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 
225 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 
223 aa  194  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.75 
 
 
225 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0392  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.66 
 
 
222 aa  192  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  44.75 
 
 
223 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 
223 aa  191  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.21 
 
 
223 aa  191  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  44.29 
 
 
223 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  44.29 
 
 
223 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1190  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 
227 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 
230 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 
225 aa  188  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0310  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.66 
 
 
232 aa  187  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214332  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0550  response regulator transcription regulator protein  49.1 
 
 
232 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.837595  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  43.84 
 
 
226 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.03 
 
 
224 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0310  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 
223 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4259  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 
225 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648982  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3523  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 
235 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  44.29 
 
 
223 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.29 
 
 
223 aa  185  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4138  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 
239 aa  184  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.794435  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4554  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.66 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4547  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.66 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.66 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4687  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.66 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.20519  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.66 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514718  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.87 
 
 
220 aa  182  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 
220 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 
228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 
223 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 
224 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 
223 aa  181  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  45 
 
 
226 aa  181  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3879  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.66 
 
 
222 aa  180  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  41.1 
 
 
220 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  41.1 
 
 
220 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  43.89 
 
 
223 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 
223 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 
223 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1322  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 
239 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.596062 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  41.1 
 
 
220 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 
221 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 
224 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BasS  42.66 
 
 
222 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  43.84 
 
 
223 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4353  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.66 
 
 
222 aa  179  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  43.64 
 
 
223 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 
221 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4578  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.66 
 
 
222 aa  179  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800667  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5626  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.66 
 
 
222 aa  179  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 
221 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3914  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.66 
 
 
222 aa  179  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.730701  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4667  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.66 
 
 
222 aa  179  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 
221 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 
223 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>