More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0710 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0710  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00420398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0058  two component transcriptional regulator  60.37 
 
 		 221 aa  273  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551146  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1328  DNA-binding response regulator  55.86 
 
 		 228 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00114355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2301  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.6 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205811  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23930  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.93 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00212671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1236  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.28 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.33 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  38.74 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  38.74 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.76 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  40.3 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0373  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 237 aa  158  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  40.29 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  39.8 
 
 		 224 aa  158  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  38.1 
 
 		 253 aa  156  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.27 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 236 aa  154  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.2 
 
 		 225 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 240 aa  154  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.2 
 
 		 225 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  39.81 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03590  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  37.73 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0594239 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  37.9 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.65 
 
 		 226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 283 aa  151  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 224 aa  151  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 231 aa  151  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 229 aa  151  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.42 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  38.81 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 263 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.78 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.78 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.41 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  37.09 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  37.68 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 652 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.82 
 
 		 225 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.64 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.79 
 
 		 223 aa  148  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 223 aa  148  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  36.79 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.82 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.82 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  37.73 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  36.79 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.07 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  36.82 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  36.45 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  37.31 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  36.82 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  37.22 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0612  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  35.82 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.41 
 
 		 243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  37.81 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.81 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  39.81 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  34.88 
 
 		 232 aa  145  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  35.91 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.2 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  36.2 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  36.32 
 
 		 223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.16 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  36.59 
 
 		 243 aa  144  9e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.83 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  37.91 
 
 		 799 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.31 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2453  winged helix family two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 236 aa  144  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  38.31 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.83 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.16 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  37.31 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  38.81 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  38.12 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.32 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0990  transcriptional regulator  34.84 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166767  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  35.82 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.82 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  36.23 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>