More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5059 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 222 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  95.95 
 
 		 222 aa  420  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  71.69 
 
 		 221 aa  323  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  65.91 
 
 		 223 aa  290  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  57.53 
 
 		 222 aa  259  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  57.99 
 
 		 239 aa  257  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  55.5 
 
 		 224 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  55.05 
 
 		 226 aa  241  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  55.5 
 
 		 224 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  55.5 
 
 		 224 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  55.05 
 
 		 224 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  55.05 
 
 		 224 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  55.56 
 
 		 222 aa  235  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3603  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.71 
 
 		 226 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3281  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.71 
 
 		 226 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3958  two component transcriptional regulator  52.05 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4036  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.82 
 
 		 225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  55.05 
 
 		 230 aa  231  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  54.59 
 
 		 287 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  54.59 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  54.59 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  54.59 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  54.59 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0496  two component transcriptional regulator  51.82 
 
 		 225 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  54.59 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3392  response regulator transcription regulator protein  53.88 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  54.59 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  53.67 
 
 		 226 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3924  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0008  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3057  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 228 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2924  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4078  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0729773  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0208  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3339  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3386  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4004  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1619  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1045  two component transcriptional regulator  54.13 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0254823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2983  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3256  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0093  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0074  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.948307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2980  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0066  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0075  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0075  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2701  DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1851  DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2676  DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0255  DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3276  DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0042  DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0042  DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0032  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0039  DNA-binding response regulator  49.77 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  49.54 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2580  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.38 
 
 		 231 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0022  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 225 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3340  two component transcriptional regulator  52.31 
 
 		 224 aa  211  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0040  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0030  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0031  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0049  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2928  transcriptional regulatory protein TctD  48.62 
 
 		 224 aa  208  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2981  transcriptional regulator TctD  48.62 
 
 		 224 aa  208  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.510212 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3084  transcriptional regulator TctD  48.62 
 
 		 224 aa  208  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2964  transcriptional regulator TctD  48.62 
 
 		 224 aa  208  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4040  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 232 aa  208  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2897  DNA-binding response regulator TctD  48.62 
 
 		 224 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1364  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.92 
 
 		 224 aa  207  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  50.46 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.79 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  50.46 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3585  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 224 aa  205  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50 
 
 		 223 aa  203  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  50 
 
 		 223 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3332  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.17 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.08 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  48.86 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2935  putative response regulator transcription regulator protein  50 
 
 		 235 aa  198  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  47.27 
 
 		 223 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3212  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.54 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2865  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.54 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1736  two-component response regulator transcription regulator protein  51.58 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3389  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.95 
 
 		 231 aa  194  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  194  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 235 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>